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samply

SampleLocator Docker镜像是基于Angular的前端应用镜像，用于部署样本定位应用，支持通过环境变量配置连接搜索代理、术语服务器、认证服务等后端组件，无需预先构建，直接构建镜像即可运行。

下载次数: 0状态：社区镜像维护者：samply仓库类型：镜像最近更新：2 年前

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https://xuanyuan.cloud/agents.md

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镜像标签列表与下载命令

SampleLocator Docker镜像文档

镜像概述

SampleLocator Docker镜像是用于部署SampleLocator前端应用的容器化解决方案。该应用基于Angular CLI v9.0.3构建，提供样本定位功能。镜像内置构建容器，无需预先执行ng build --prod，直接构建即可生成可运行的应用。

核心功能与特性

自动构建：内置构建容器，无需手动执行前端构建命令
环境变量配置：通过环境变量灵活配置后端服务连接信息
多服务集成：支持连接搜索代理(SEARCHBROKER)、术语服务器、认证服务(AUTH)、MDR等后端组件
特性控制：通过特性开关(FEATURE_STRATIFIER)控制分层功能的启用
灵活定制：可配置MDR字段映射、属性、隐藏字段等

使用场景与适用范围

适用于需要部署SampleLocator前端应用的环境，特别适合生物样本库相关系统，用于样本定位和搜索功能的前端展示。需与指定的后端服务（如Searchbroker API、Negotiator、术语服务器等）配合使用。

使用方法

构建Docker镜像

在项目根目录执行以下命令构建镜像：

bash
docker build -t sample-locator .

运行Docker容器

使用以下命令运行容器，根据实际环境调整环境变量值：

bash
docker run \
    --rm \
    --name=sample-locator \
    -p 8085:80 \
    -e SEARCHBROKER_URL="http://localhost:8080" \
    -e SAMPLELOCATOR_URL="http://localhost:8085" \
    -e NEGOTIATOR_URL="https://negotiator.bbmri-eric.eu" \
    -e TERMINOLOGY_SERVER_URL="https://r4.ontoserver.csiro.au/fhir" \
    -e AUTH_HOST="https://login.bbmri-eric.eu" \
    -e AUTH_CLIENT_ID="88ad6e4f-af9b-430a-8884-394e29cd10c1" \
    -e MDR_API_URL="http://mdr.test.germanbiobanknode.de/v3/api/mdr" \
    -e MDR_NAMESPACE="mdr16" \
    -e MDR_LANGUAGE="en" \
    -e MDR_MAPPING="[{\"nameOfEnum\": \"DONOR\",\"urn\": \"urn:mdr16:dataelementgroup:5:1\"},{\"nameOfEnum\": \"SAMPLE\",\"urn\": \"urn:mdr16:dataelementgroup:3:1\"},{\"nameOfEnum\": \"EVENT\", \"urn\": \"urn:mdr16:dataelementgroup:6:1\"}]" \
    -e MDR_FIELD_PROPERTIES="[{\"urn\": \"urn:mdr16:dataelement:29:1\",\"placeholder\": \"\",\"unit\": \"kg\"},{\"urn\": \"urn:mdr16:dataelement:30:1\",\"placeholder\": \"\",\"unit\": \"cm\"},{\"urn\": \"urn:mdr16:dataelement:28:1\",\"placeholder\": \"\",\"unit\": \"years\"},{\"urn\": \"urn:mdr16:dataelement:14:1\",\"placeholder\": \"\",\"unit\": \"years\"},{\"urn\": \"urn:mdr16:dataelement:27:1\",\"placeholder\": \"e.g. C25.1\",\"unit\": \"\", \"valueSetUrl\": \"http://hl7.org/fhir/ValueSet/condition-code\"}]" \
    -e MDR_HIDDEN="[\"urn:mdr16:dataelement:1:1\",\"urn:mdr16:dataelement:25:1\",\"urn:mdr16:dataelement:34:1\",\"urn:mdr16:dataelement:18:1\",\"urn:mdr16:dataelement:11:1\",\"urn:mdr16:dataelement:19:1\",\"urn:mdr16:dataelement:30:1\",\"urn:mdr16:dataelement:4:1\",\"urn:mdr16:dataelement:21:1\",\"urn:mdr16:dataelement:22:1\",\"urn:mdr16:dataelement:24:1\",\"urn:mdr16:dataelement:13:1\"]" \
    -e MOLGENIS_USERNAME="your_molgenis_username" \
    -e MOLGENIS_PASSWORD="your_molgenis_password" \
    docker.xuanyuan.run/sample-locator:latest

环境变量配置说明

环境变量	含义	默认值
SAMPLELOCATOR_URL	Sample Locator应用的URL	无
SEARCHBROKER_URL	搜索代理API（后端）的URL	无
NEGOTIATOR_URL	Negotiator的URL	无
TERMINOLOGY_SERVER_URL	术语服务器的URL	无
AUTH_HOST	OpenID Connect提供者的URL	无
AUTH_CLIENT_ID	OpenID Connect提供者的客户端ID	无
MOLGENIS_USERNAME	Molgenis的用户名	无
MOLGENIS_PASSWORD	Molgenis的密码	无
MDR_API_URL	MDR的URL	无
MDR_NAMESPACE	MDR的命名空间	无
MDR_LANGUAGE	MDR的语言代码	无
MDR_MAPPING	MDR实体及其URN的映射	[]
MDR_FIELD_PROPERTIES	字段的占位符和单位规范	[]
MDR_HIDDEN	需要忽略的字段	[]
FEATURE_STRATIFIER	分层功能的特性开关	false
FEATURE_STRATIFIER_MIN_NO_BIOBANKS	显示分层所需的最小连接器数量	3

许可证

根据Apache License 2.0许可协议授权。您不得使用此文件，除非符合许可协议的规定。您可以在以下地址获取许可协议的副本：

http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0

除非适用***要求或书面同意，否则根据许可协议分发的软件按"原样"分发，不提供任何明示或暗示的担保或条件。有关许可协议下权限和限制的具体规定，请参阅许可协议。

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 sample-locator 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/samply/sample-locator:<标签>

使用方法：

DockerHub 原生拉取命令

docker pull samply/sample-locator:<标签>

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