terraref/ext-multispectral-flir2tif

FLIR转换器

镜像概述

该镜像为TERRA-REF项目的FLIR红外相机数据处理工具，适配Clowder平台，专注于将FLIR红外相机生成的二进制文件（_ir.bin）转换为具有地理空间属性的TIFF文件和热力图PNG文件，同时将温度数据导入特征数据库。

核心功能

• 自动监测数据集新增文件，触发对_ir.bin文件的处理流程
• 生成热力图PNG文件，直观展示温度分布
• 输出包含地理空间属性和像素级温度（单位：摄氏度）的TIFF文件
• 根据元数据"calibrated"字段选择温度计算逻辑：校准模式使用FlirRawToTemperature.m，非校准模式按100mk单位处理原始数据
• 将温度数据以"surface_temperature"名称插入特征数据库（遵循CF conventions标准）

使用场景

适用于农业监测、环境研究等领域，帮助用户自动化处理FLIR红外相机数据，快速获取带地理空间信息的温度数据，支撑科学分析与决策。

配置说明

Docker部署

构建镜像

bash
docker build -f Dockerfile -t terra-ext-flir2tif .

本地运行

bash
docker run \
  -p 5672 -p 9000 --add-host="localhost:{LOCAL_IP}" \
  -v /local/raw_data/folder:/home/extractor/sites/ua-mac/raw_data \
  -v /local/output/root/folder:/home/extractor/sites/ua-mac/Level_1/flir2tif \
  -e RABBITMQ_URI=amqp://{RMQ_USER}:{RMQ_PASSWORD}@localhost:5672/%2f \
  -e RABBITMQ_EXCHANGE=clowder \
  -e REGISTRATION_ENDPOINTS=http://localhost:9000/clowder/api/extractors?key={SECRET_KEY} \
  -e INFLUXDB_PASSWORD={INFLUX_PASS} \
  terra-ext-flir2tif

注意：RabbitMQ默认不允许"guest:guest"用户访问非本地地址（含Docker环境），需创建本地测试用户。

远程运行

bash
docker run \
  -v /sites/ua-mac/raw_data:/home/extractor/sites/ua-mac/raw_data \
  -v /sites/ua-mac/Level_1/flir2tif:/home/extractor/sites/ua-mac/Level_1/flir2tif \
  -e RABBITMQ_URI=amqp://{RMQ_USER}:{RMQ_PASSWORD}@rabbitmq.ncsa.illinois.edu/clowder \
  -e RABBITMQ_EXCHANGE=terra \
  -e REGISTRATION_ENDPOINTS=http://terraref.ncsa.illinois.edu/clowder/api/extractors?key={SECRET_KEY} \
  -e INFLUXDB_PASSWORD={INFLUX_PASS} \
  terra-ext-flir2tif

依赖说明

• Python版本：2.7及以上
• 第三方库：PIL、scipy、numpy、matplotlib、osgeo

注意事项

• flir_test.sh为示例脚本，通过-i指定单日FLIR数据输入目录，-o指定输出目录。
• 特征数据库中温度数据名称采用CF conventions的"surface_temperature"，因未过滤土壤且符合表面温度定义。