dnanexus/dxcompiler

dxCompiler Docker镜像移除通知

镜像概述与移除通知

镜像用途

dxCompiler Docker镜像是用于在DNAnexus平台上编译工作流的工具镜像，原提供于DockerHub，主要帮助用户将工作流定义编译为可在DNAnexus平台运行的格式。

移除通知

重要提示：该Docker镜像将于2024年12月1日之后永久移除。为避免服务中断，所有用户需尽快停止使用DockerHub上的dxCompiler Docker镜像。

移除影响说明

• 现有部署：2024年12月1日后，DockerHub上的dxCompiler镜像将无法访问，依赖该镜像的工作流编译流程将中断。
• 功能替代：原镜像功能需通过其他方式实现，具体迁移方案见下文。

后续操作指南

1. 立即停止使用DockerHub镜像

• 检查所有依赖 dxcompiler Docker镜像的流程（如CI/CD管道、本地开发环境），停止相关容器部署。
• 示例：若当前使用如下命令运行容器，需终止并移除：

  bash
  # 停止并删除现有容器（如有）
  docker stop dxcompiler-container
  docker rm dxcompiler-container
  

2. 迁移至无镜像编译流程

无需依赖Docker镜像，直接按照DNAnexus官方指南编译工作流：

• 参考文档：https://github.com/dnanexus/dxCompiler/blob/develop/doc/ExpertOptions.md#getting-started
• 核心步骤：
  1. 安装dxCompiler核心工具（不通过Docker）
  2. 直接使用本地dxCompiler命令编译工作流至DNAnexus平台

3. 自建Docker镜像（可选）

如需继续使用容器化部署，可自行构建dxCompiler Docker镜像：

• 构建指南：https://github.com/dnanexus/dxCompiler/blob/develop/scripts/docker_image/README.md
• 基本步骤：
  1. 克隆dxCompiler源码仓库
  2. 执行仓库中提供的Docker构建脚本
  3. 使用自建镜像替代原DockerHub镜像

迁移建议

• 时间规划：建议在2024年12月1日前完成迁移，避免服务中断。
• 测试验证：迁移后需验证工作流编译功能是否正常，确保与DNAnexus平台兼容性。
• 技术支持：相关问题可参考dxCompiler GitHub仓库的Issue或文档。

联系方式

如需进一步帮助，可通过DNAnexus官方支持渠道或dxCompiler GitHub仓库提交咨询。