ersiliaos/eos12x7
ersiliaos
该镜像提供分子空间复杂度的拓扑指标计算工具，可计算SPS（空间分数）及其归一化变体nSPS，支持不同大小分子的复杂度比较，适用于化合物属性分析与药物研发相关场景。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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分子复杂度的空间分数拓扑指标
本工具计算空间分数（SPS）及其大小归一化变体（nSPS），这两个分子空间复杂度的经验描述符扩展了Fsp3和FCstereo等常见指标，能在细粒度上捕捉分子拓扑和三维结构特征。归一化分数允许不同大小分子间的比较，并可区分天然产物与合成化合物。ChEMBL数据分析显示，nSPS值越高，分子的活性和选择性往往越强。
该模型于2026年1月20日纳入Ersilia模型库，最后打包时间为2026年3月23日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos12x7 - 别名:
spacial-score-complexity
领域
- 任务:
注释 - 子任务:
属性计算或预测 - 生物医学领域:
通用 - 目标生物:
通用 - 标签:
描述符,合成可及性
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
2 - 输出一致性:
固定 - 解释: 通过RdKIT计算的空间分数
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| sps_score | 整数 | 高 | 基于分子空间特征的复杂度分数 |
| nsps_score | 浮点数 | 高 | 归一化空间分数 |
来源与部署
- 来源:
本地 - 来源类型:
外部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos12x7
- Docker架构:
AMD64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos12x7.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）:
1 - 环境大小（Mb）:
509 - 镜像大小（Mb）:
452.06
计算性能（秒）:
- 10个输入:
34.15 - 100个输入:
26.93 - ***个输入:
44.53
参考文献
- 源代码: https://github.com/frog2000/Spacial-Score
- 出版物: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c00689
- 出版物类型:
同行评审 - 出版年份:
2023 - Ersilia贡献者: https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8BSD-3-Clause%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: Ersilia直接从原作者处提供模型访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
本地使用需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E5%B7%A5%E5%85%B7%E3%80%82
步骤
- 获取模型:
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos12x7
- 服务与运行:
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos12x7 # 生成示例输入文件（3条数据） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos12x7:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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Linux服务器
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