ersiliaos/eos1amr
ersiliaos
该模型使用MoleculeNet基准数据（2000个实验数据点）训练，基于GROVER transformer预测小分子的血脑屏障（BBB）穿透潜力，输出穿透概率，Ersilia标识符为eos1amr。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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血脑屏障穿透预测模型
镜像概述和主要用途
本模型用于预测小分子的血脑屏障（BBB）穿透潜力，训练数据来源于经过整理的MoleculeNet基准数据集，包含2000个实验数据点。模型采用GROVER transformer架构（分子特征化步骤详见eos7w6n或grover-embedding）。该模型于2021年5月7日纳入，最后打包时间为2026年3月10日。
核心功能和特性
- 基于GROVER transformer的化学图模型，实现小分子血脑屏障穿透潜力预测
- 输入为单个化合物，输出为固定维度的穿透概率值
- 提供量化的穿透概率结果，支持ADMET相关研究和药物开发决策
使用场景和适用范围
- 生物医学领域：ADMET（吸收、分布、代谢、排泄、毒性）性质研究
- 药物研发：中枢神经系统药物设计（如阿尔茨海默病治疗药物）的早期筛选
- 化学信息学：小分子渗透性预测及相关性质评估
详细信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos1amr - Slug：
grover-bbbp
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
性质计算或预测 - 生物医学领域：
ADMET - 目标生物：
智人（Homo sapiens） - 标签：
渗透性、MoleculeNet、化学图模型、阿尔茨海默病
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释：分子穿透血脑屏障的概率
输出列说明：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| p_np | float | high | 血脑屏障穿透概率 |
来源和部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos1amr
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos1amr.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1404 - 环境大小（Mb）：
2406 - 镜像大小（Mb）：
6623.19
计算性能（秒）：
- 10个输入：
35.37 - 100个输入：
160.85 - ***个输入：
-1（未测试）
参考文献
- 源代码：https://github.com/tencent-ailab/grover
- 出版物：https://arxiv.org/abs/2007.02835
- 出版物类型：
同行评审 - 出版年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia按原样提供模型，直接来自原作者。使用模型时，请参考原始代码库和/或出版物。
使用方法
本地使用需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos1amr
服务、运行和关闭模型
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos1amr # 生成包含3个示例的输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型，输入文件为my_input.csv，输出结果保存至my_output.csv ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos1amr:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
5
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