ersiliaos/eos1klk
ersiliaos
该镜像提供基于Ersilia参考库训练的2D投影模型，支持PCA、UMAP、t-SNE和TMAP四种投影方法，输出化合物在参考化学空间的二维坐标。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：1 个月前
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基于Ersilia参考库训练的2D投影模型
该模型使用lazy-chemvis工具，以包含130万种化合物的Ersilia参考库作为化学空间参考，执行PCA、UMAP、t-SNE和TMAP投影。它采用ECFP4指纹（2048位）和RDKit理化描述符作为分子描述符，每种投影方法返回两个坐标。
该模型于2026年3月10日纳入，最后打包于2026年5月28日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos1klk - 别名：
lazychemvis-reference-library
领域
- 任务：
Representation（表示） - 子任务：
Projection（投影） - 生物医学领域：
Any（任意） - 目标生物：
Any（任意） - 标签：
Embedding（嵌入）
输入
- 输入类型：
Compound（化合物） - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
8 - 输出一致性：
Fixed（固定） - 解释：2D投影的坐标，包括PCA、UMAP、tSNE和TMAP。
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| pca_x | float | 参考化学空间上的第一主成分投影 |
| pca_y | float | 参考化学空间上的第二主成分投影 |
| tmap_x | float | 参考化学空间上的第一TMAP维度投影 |
| tmap_y | float | 参考化学空间上的第二TMAP维度投影 |
| tsne_x | float | 参考化学空间上的第一TSNE维度投影 |
| tsne_y | float | 参考化学空间上的第二TSNE维度投影 |
| umap_x | float | 参考化学空间上的第一UMAP维度投影 |
| umap_y | float | 参考化学空间上的第二UMAP维度投影 |
来源与部署
- 来源：
Local（本地） - 来源类型：
Internal（内部） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos1klk
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos1klk.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
340 - 环境大小（Mb）：
8290 - 镜像大小（Mb）：
9233.2
计算性能（秒）：
- 10个输入：
33.53 - 100个输入：
37.36 - ***个输入：
871.86
参考资料
- 源代码：https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 出版物：https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 出版物类型：
Other（其他） - 出版年份：
2026 - Ersilia贡献者：https://github.com/Marina18
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
使用以下命令从Ersilia模型 hub 获取模型：
bash# 从Ersilia模型hub获取模型 ersilia fetch eos1klk
服务、运行与关闭模型
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos1klk # 生成示例文件（3个输入） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果发现该模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8Bhub%E3%80%82%E8%8B%A5%E5%9C%A8%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos1klk:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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