ersiliaos/eos24ci
ersiliaos
DrugTax接收SMILES输入，对分子进行分类学分类（有机/无机及其子类），采用0/1二元分类，生成包含163个特征的向量（包括分类信息和碳、氮原子数等关键结构信息），用于化学信息学管道中的分子表示。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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DrugTax: 药物分类学
DrugTax接收SMILES输入，根据分类学对分子进行分类（有机或无机类别及其子类），对每个类别采用0/1二元分类。它生成包含163个特征的向量，包括分类信息和其他关键信息（如碳、氮原子数量等）。这些向量可用于化学信息学管道中后续的分子表示。
该模型于2022年12月20日整合，最后打包于2026年3月10日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos24ci - 简称：
drugtax
领域
- 任务：
表示（Representation） - 子任务：
特征化（Featurization） - 生物医学领域：
通用（Any） - 目标生物：
通用（Any） - 标签：
指纹（Fingerprint）、描述符（Descriptor）
输入
- 输入类型：
化合物（Compound） - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
163 - 输出一致性：
固定（Fixed） - 解释：163维向量，每个维度对应特定的分类学或结构分子特征
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| organic | 整数 | 分子是否为有机分子（1是，0否） | |
| inorganic | 整数 | 分子是否为无机分子（1是，0否） | |
| organoheterocyclic | 整数 | 分子是否含有有机杂环基团（1是，0否） | |
| benzenoid | 整数 | 分子是否含有苯类基团（1是，0否） | |
| organosulfur | 整数 | 分子是否含有有机硫基团（1是，0否） | |
| lipid | 整数 | 分子是否含有脂类基团（1是，0否） | |
| allene | 整数 | 分子是否含有丙二烯基团（1是，0否） | |
| phenylpropanoids_and_polyketides | 整数 | 分子是否含有苯丙素类和聚酮类基团（1是，0否） | |
| carboxyl | 整数 | 分子是否含有羧基（1是，0否） | |
| organic_acid | 整数 | 分子是否含有有机酸基团（1是，0否） |
显示163列中的10列
来源与部署
- 来源：
本地（Local） - 来源类型：
外部（External） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos24ci
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos24ci.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1 - 环境大小（Mb）：
680 - 镜像大小（Mb）：
662.35
计算性能（秒）：
- 10个输入：
28.76 - 100个输入：
18.84 - ***个输入：
67.87
参考资料
- 源代码：https://github.com/MoreiraLAB/DrugTax
- 出版物：[***]
- 出版物类型：
同行评审（Peer reviewed） - 出版年份：
2022 - Ersilia贡献者：https://github.com/Femme-js
许可
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-only%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82
注意：Ersilia按原样提供模型访问，直接来自原始作者。如果在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
可通过以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型 hub 获取模型 ersilia fetch eos24ci
然后，可按以下步骤启动、运行和关闭模型：
bash# 启动模型 ersilia serve eos24ci # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。如在运行过程中遇到任何问题，请随时https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果想为我们的使命做贡献，欢迎考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos24ci:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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