ersiliaos/eos24jm
ersiliaos
该镜像提供结核分枝杆菌QcrB抑制剂活性预测模型，基于化合物输入分类其对M.tb的抑制活性等级（活性、中度活性、无活性），助力抗结核药物研发筛选。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：8 个月前
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QcrB抑制活性预测（结核分枝杆菌）
细胞色素bcc复合物（QcrB）是结核分枝杆菌细胞色素bcc-aa3氧化还原酶的亚基，参与电子传递链，因细菌依赖氧化磷酸化生长而成为潜在治疗靶点。该模型基于352个分子数据集，将化合物分为三类：活性（QIM<1uM）、中度活性（1<QIM<20uM）和无活性（QIM>20uM）。模型于2023年4月6日纳入，最后打包于2025年10月16日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos24jm - 别名：
qcrb-tb
领域
- 任务： 注释
- 子任务： 活性预测
- 生物医学领域： 结核病
- 目标生物： 结核分枝杆菌
- 标签： M.tuberculosis、抗菌活性
输入
- 输入类型： 化合物
- 输入维度： 1
输出
- 输出维度： 1
- 输出一致性： 固定
- 解释： 类别1（活性，QIM<1uM）、类别2（中度活性，1<QIM<20uM）、类别3（无活性，QIM>20uM）
输出列详情：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| class | 整数 | low | 类别1：活性（QIM<1uM）- 类别2：中度活性（1<QIM<20uM）- 类别3：无活性（QIM>20uM） |
来源与部署
- 来源： Local
- 来源类型： External
- DockerHub： https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos24jm
- Docker架构： AMD64、ARM64
- S3存储： https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos24jm.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）： 3
- 环境大小（Mb）： 805
- 镜像大小（Mb）： 779.55
计算性能（秒）：
- 10个输入：27.68
- 100个输入：17.6
- ***个输入：55.02
参考文献
- 源代码： https://github.com/CoutinhoLab/Q-TB/
- 出版物： https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acsomega.2c01613
- 出版物类型： 同行评审
- 出版年份： 2022
- Ersilia贡献者： https://github.com/GemmaTuron
许可证
该包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8CC0-1.0%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意： Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
本地使用需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%EF%BC%8C%E6%AD%A5%E9%AA%A4%E5%A6%82%E4%B8%8B%EF%BC%9A
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos24jm
然后可执行服务、运行和关闭操作：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos24jm # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos24jm:<标签>
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功能
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