ersiliaos/eos26a4
ersiliaos
该镜像提供基于Coconut库训练的2D投影模型，利用PCA、UMAP、t-SNE和TMAP方法对化合物进行投影分析，输出多种投影坐标，助力化学空间研究。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：28 天前
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基于Coconut训练的2D投影模型
这个模型使用lazy-chemvis工具，以包含715K化合物的Coconut库作为参考化学空间，执行PCA、UMAP、t-SNE和TMAP投影。采用ECFP4指纹（2048位）和RDKit理化描述符作为分子描述符，每种投影方法返回两个坐标。该模型于2026年3月23日纳入，最后打包于2026年5月28日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos26a4 - 别名：
lazychemvis-coconut
领域
- 任务：
表示 - 子任务：
投影 - 生物医学领域：
通用 - 目标生物：
通用 - 标签：
嵌入
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
8 - 输出一致性：
固定 - 解释：2D投影的坐标，即PCA、UMAP、tSNE和TMAP的坐标。
输出列
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| pca_x | float | 参考化学空间上的第一主成分投影 |
| pca_y | float | 参考化学空间上的第二主成分投影 |
| tmap_x | float | 参考化学空间上的第一TMAP维度投影 |
| tmap_y | float | 参考化学空间上的第二TMAP维度投影 |
| tsne_x | float | 参考化学空间上的第一TSNE维度投影 |
| tsne_y | float | 参考化学空间上的第二TSNE维度投影 |
| umap_x | float | 参考化学空间上的第一UMAP维度投影 |
| umap_y | float | 参考化学空间上的第二UMAP维度投影 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
内部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos26a4
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos26a4.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
198 - 环境大小（Mb）：
8290 - 镜像大小（Mb）：
8733.84
计算性能（秒）：
- 10个输入：
39.16 - 100个输入：
35.08 - ***个输入：
572.3
引用
- 源代码：https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 出版物：https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 出版物类型：
其他 - 出版年份：
2026 - Ersilia贡献者：https://github.com/Marina18
许可
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82%E5%8F%AF%E9%80%9A%E8%BF%87%E4%BB%A5%E4%B8%8B%E5%91%BD%E4%BB%A4%E8%8E%B7%E5%8F%96%E6%A8%A1%E5%9E%8B%EF%BC%9A
bash# 从Ersilia模型hub获取模型 ersilia fetch eos26a4
然后，可按以下步骤服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos26a4 # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos26a4:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
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Linux服务器
5
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