ersiliaos/eos2a9n
ersiliaos
该镜像用于根据ECFP4 Tanimoto相似度在ChEMBL数据库中查找给定分子的100个最近邻，核心功能为分子相似性搜索，因大小限制，查询会重定向到ChEMBL服务器，预测结果在线发布。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：4 个月前
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ChEMBL中的相似性搜索
给定一个分子，该模型根据ECFP4 Tanimoto相似度在ChEMBL数据库中查找其100个最近邻。由于大小限制，模型会将查询重定向到ChEMBL服务器，因此使用该模型时预测结果会在线发布。
本模型于2022-08-20纳入，最后打包日期为2026-02-11。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos2a9n - 简称:
chembl-similarity
领域
- 任务:
采样 - 子任务:
相似性搜索 - 生物医学领域:
任意 - 目标生物:
任意 - 标签:
ChEMBL,Similarity
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
100 - 输出一致性:
固定 - 解释: 100个最近邻的列表
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| smiles_00 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 0 | |
| smiles_01 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 1 | |
| smiles_02 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 2 | |
| smiles_03 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 3 | |
| smiles_04 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 4 | |
| smiles_05 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 5 | |
| smiles_06 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 6 | |
| smiles_07 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 7 | |
| smiles_08 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 8 | |
| smiles_09 | string | 从ChEMBL相似性搜索中采样的SMILES 9 |
显示100列中的10列
来源与部署
- 来源:
在线 - 来源类型:
外部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos2a9n
- Docker架构:
AMD64,ARM64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos2a9n.zip
资源消耗
- 模型大小 (Mb):
1 - 环境大小 (Mb):
305 - 镜像大小 (Mb):
293.54
计算性能 (秒):
- 10个输入:
51.06 - 100个输入:
-1 - ***个输入:
-1
参考文献
- 源代码: [***]
- 出版物: [***]
- 出版物类型:
同行评审 - 出版年份:
2020 - Ersilia贡献者: https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8%E6%97%A0%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: Ersilia按原样提供对模型的访问，直接来自原作者。如果您在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
可通过以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos2a9n
然后，可按以下方式服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos2a9n # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果您发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E5%A6%82%E5%9C%A8%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos2a9n:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"