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eos2gth

ersiliaos/eos2gth

ersiliaos

该镜像提供预测小分子抗疟疾潜力的模型,基于ChEMBL数据训练替代模型,输出MAIP分数指示抗疟潜力,适用于药物研发中筛选相关化合物。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:ersiliaos仓库类型:镜像最近更新:7 个月前
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MAIP蒸馏:抗疟疾潜力预测

镜像概述

本镜像包含用于预测小分子抗疟疾潜力的模型。原模型基于Evotec、约翰霍普金斯大学等机构的专有数据(超700万化合物)训练,本实现采用师生学习方法,基于ChEMBL数据(200万分子)训练替代模型,提供轻量可下载版本。模型于2021年11月2日纳入Ersilia模型库,最后打包时间为2025年11月19日。

核心功能

  • 任务类型:活性预测(Annotation → Activity prediction)
  • 适用领域:疟疾生物医学研究,针对恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)
  • 输入:单个化合物(维度1)
  • 输出:MAIP分数(浮点型,维度1),分数越高表示抗疟疾潜力越强
  • 性能指标:处理10个输入约27.81秒,100个约17.62秒,***个约65.3秒

使用场景

适用于药物研发过程中快速筛选具有潜在抗疟疾活性的小分子化合物,辅助研究人员评估化合物的抗疟潜力,加速抗疟药物候选物的发现流程。

配置说明

前提条件

需安装Ersilia CLI工具(https://github.com/ersilia-os/ersilia%EF%BC%89%E3%80%82

操作步骤

  1. 获取模型
bash
ersilia fetch eos2gth
  1. 启动模型服务
bash
ersilia serve eos2gth
  1. 生成示例输入文件
bash
ersilia example -n 3 -f my_input.csv
  1. 运行模型预测
bash
ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv
  1. 关闭模型服务
bash
ersilia close

资源信息

  • 模型大小:12MB
  • 环境大小:1263MB
  • 镜像大小:1404.84MB

参考信息

  • 源代码:[***]
  • 出版物:[***]
  • 许可证:镜像包采用GPL-3.0许可证,模型本身无明确许可证

关于Ersilia

Ersilia开源计划是一家科技非营利组织,致力于推动全球南方的可持续研究。若使用本模型,请引用Ersilia模型库,并在遇到问题时反馈至https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E5%A6%82%E9%9C%80%E6%94%AF%E6%8C%81%E5%85%B6%E4%BD%BF%E5%91%BD%EF%BC%8C%E5%8F%AF%E8%80%83%E8%99%91***%E3%80%82

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 eos2gth 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/ersiliaos/eos2gth:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull ersiliaos/eos2gth:<标签>

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