如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具,协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题,请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
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该模型用于预测小分子对抗曼氏血吸虫(Schistosoma Mansoni)的活性。由Ersilia基于瑞士热带与公共卫生研究所(Swiss TPH)提供的数据开发,数据来源于多个药物库的体外筛选,包括Cancer Drug Library(Cowan et al, 2015)、FDA Library(Panic et al, 2015)、Pandemic Response Box(Biendl et al, 2021)、Pathogen Box(Pasche et al, 2019)和Malaria Box(Ingram-Sieber, 2014)。模型测量了小分子对新转化血吸虫(nts)和成虫的体外活性(分别为抑制率%和IC50,根据文献二值化为活性/非活性),通过LazyQSAR进行数据聚合和建模,AUROCS范围为0.7-0.89。模型于2023-08-24纳入,最后打包时间为2025-11-25。
eos2l0qschisto-swisstphAnnotation(注释)Activity prediction(活性预测)Schistosomiasis(血吸虫病)Schistosoma mansoni(曼氏血吸虫)Neglected tropical disease(被忽视热带病)、Schistosomiasis(血吸虫病)、IC50Compound(化合物)16Fixed(固定)输出列说明
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| nts_perc_10 | float | high | 基于单点(10μM药物浓度)抑制率的曼氏血吸虫新转化血吸虫(NTS)抑制概率 |
| nts_perc | float | high | 基于单点(10μM和33μM聚合)抑制率的曼氏血吸虫NTS抑制概率 |
| nts_ic50 | float | high | 基于IC50检测的曼氏血吸虫NTS抑制概率 |
| adult_perc_33 | float | high | 基于单点(33μM药物浓度)抑制率的曼氏血吸虫成虫抑制概率 |
| adult_perc | float | high | 基于单点(10μM和33μM聚合)抑制率的曼氏血吸虫成虫抑制概率 |
| adult_ic50 | float | high | 基于IC50检测的曼氏血吸虫成虫抑制概率 |
Local(本地)Internal(内部)AMD64、ARM641876107525.11计算性能(秒)
43.7277.931267.34Other(其他)2023本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意:Ersilia直接从原作者处提供模型访问,若在研究中使用该模型,请参考原始代码仓库和/或出版物。
适用于抗血吸虫病药物研发中的小分子活性筛选,可辅助早期药物发现,评估化合物对曼氏血吸虫新转化虫体和成虫的抑制潜力,尤其适用于被忽视热带病研究领域。
需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
bash# 从Ersilia模型 hub 获取模型 ersilia fetch eos2l0q
服务启动与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos2l0q # 生成示例输入文件(3个化合物) ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型预测 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
Ersilia开源计划是一家技术非营利组织,致力于推动全球南方的可持续研究。若发现该模型有用,请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。运行中遇到任何问题,请https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E8%8B%A5%E5%B8%8C%E6%9C%9B%E6%94%AF%E6%8C%81%E6%88%91%E4%BB%AC%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%EF%BC%8C%E6%AC%A2%E8%BF%8E***%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
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