ersiliaos/eos2mhp
ersiliaos
该镜像提供BACE-1抑制剂预测模型，基于MoleculeNet的BACE数据集和GROVER transformer训练，用于评估分子抑制β-分泌酶1（与阿尔茨海默病相关）的概率。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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BACE-1抑制预测
预测β-分泌酶1（BACE-1）的抑制作用。BACE-1主要在神经元中表达，与阿尔茨海默病的发展相关。该模型基于MoleculeNet的BACE数据集，使用GROVER transformer训练（分子特征提取步骤详见eos7w6n或grover-embedding）。模型于2022年7月13日纳入，最后打包时间为2026年3月10日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos2mhp - 别名：
grover-bace
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
活性预测 - 生物医学领域：
阿尔茨海默病 - 目标生物：
智人（Homo sapiens） - 标签：
阿尔茨海默病、BACE、MoleculeNet、化学图模型
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释：分子作为BACE-1抑制剂的概率（使用0.1μM阈值）
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| bace_inhibition | 浮点数 | high | 抑制BACE1蛋白的概率 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos2mhp
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：[***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1378 - 环境大小（Mb）：
2406 - 镜像大小（Mb）：
6565.8
计算性能（秒）：
- 10个输入：
34.99 - 100个输入：
159.34 - ***个输入：
-1（未测试）
参考文献
- 源代码：https://github.com/tencent-ailab/grover
- 出版物：[***]
- 出版物类型：
预印本 - 出版年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
使用以下命令从Ersilia模型 hub 获取模型：
bash# 从Ersilia模型hub获取模型 ersilia fetch eos2mhp
服务、运行与关闭
获取后，可按以下步骤服务、运行和关闭模型：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos2mhp # 生成包含3个示例的输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一家技术非营利组织，旨在为全球南方地区推动可持续研究。如果该模型对您有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8Bhub%E3%80%82%E8%8B%A5%E8%BF%90%E8%A1%8C%E6%97%B6%E9%81%87%E5%88%B0%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E5%A6%82%E6%9E%9C%E6%82%A8%E6%83%B3%E4%B8%BA%E6%88%91%E4%BB%AC%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%E5%81%9A%E5%87%BA%E8%B4%A1%E7%8C%AE%EF%BC%8C%E6%AC%A2%E8%BF%8E%E8%80%83%E8%99%91***%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos2mhp:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"