ersiliaos/eos2mxh

Chemical Checker Signaturizer 3D B1-5

基于Chemical Checker生物活性签名（可作为eos4u6p获取），作者利用超过100万种化合物的立体异构体与生物活性之间的关系，训练了具有立体化学感知的签名生成器，能够更好地描述小分子生物活性特性。该模型对应Chemical Checker空间B1、B2、B3、B4和B5。

此模型于2025年6月25日整合，最后打包时间为2025年12月30日。

信息

标识符

• Ersilia标识符: eos2mxh
• 简称: cc-signaturizer-3d-b

领域

• 任务: 表示（Representation）
• 子任务: 特征化（Featurization）
• 生物医学领域: 通用（Any）
• 目标生物: 通用（Any）
• 标签: 描述符（Descriptor）, 生物活性谱（Bioactivity profile）, 嵌入（Embedding）

输入

• 输入类型: 化合物（Compound）
• 输入维度: 1

输出

• 输出维度: 640
• 输出一致性: 固定（Fixed）
• 解释: 分子的向量表示

以下是模型的输出列：

显示640列中的10列

来源和部署

• 来源: 本地（Local）
• 来源类型: 外部（External）
• DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos2mxh
• Docker架构: AMD64, ARM64
• S3存储: [***]

资源消耗

• 模型大小 (Mb): 2728
• 环境大小 (Mb): 1295
• 镜像大小 (Mb): 9468.76

计算性能（秒）:

• 10个输入: 32.54
• 100个输入: 98.76
• ***个输入: -1

参考文献

• 源代码: [***]
• 出版物: [***]
• 出版物类型: 同行评审（Peer reviewed）
• 出版年份: 2024
• Ersilia贡献者: https://github.com/arnaucoma24

许可证

此软件包根据https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E6%8E%88%E6%9D%83%E3%80%82%E6%AD%A4%E8%BD%AF%E4%BB%B6%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E6%A0%B9%E6%8D%AEGPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E6%8E%88%E6%9D%83%E3%80%82

注意：Ersilia直接从原作者提供对模型的"原样"访问，如果您在研究中使用该模型，请参考原始代码库和/或出版物。

使用方法

要在本地使用此模型，您需要安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82

可以使用以下命令获取模型：

bash
# 从Ersilia模型中心获取模型
ersilia fetch eos2mxh

然后，您可以按以下方式服务、运行和关闭模型：

bash
# 服务模型
ersilia serve eos2mxh
# 生成示例文件
ersilia example -n 3 -f my_input.csv
# 运行模型
ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv
# 关闭模型
ersilia close

关于Ersilia

Ersilia开源计划是一个技术非营利组织，为全球南方的可持续研究提供动力。

如果您发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E5%A6%82%E6%9E%9C%E6%82%A8%E5%9C%A8%E5%B0%9D%E8%AF%95%E8%BF%90%E8%A1%8C%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E6%97%B6%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82

如果您想为我们的使命做出贡献，请考虑***给Ersilia！