ersiliaos/eos2sbn
ersiliaos
该镜像提供Chemical Checker Signaturizer 3D A1-5模型，用于提取小分子化合物的生物活性特征向量，支持化合物的表示与特征化任务。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：6 个月前
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Chemical Checker Signaturizer 3D A1-5模型
基于Chemical Checker生物活性特征（可通过eos4u6p获取），作者利用超过100万种化合物的立体异构体与生物活性之间的关系，训练了具有立体化学感知的特征提取器，以更好地描述小分子的生物活性特性。该模型对应Chemical Checker空间A1、A2、A3、A4和A5，于2025-06-25纳入Ersilia Model Hub，最后打包时间为2025-12-24。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos2sbn - 别名：
cc-signaturizer-3d-a
领域
- 任务： 表示（Representation）
- 子任务： 特征化（Featurization）
- 生物医学领域： 通用（Any）
- 目标生物： 通用（Any）
- 标签： 描述符（Descriptor）、生物活性谱（Bioactivity profile）、嵌入（Embedding）
输入
- 输入类型： 化合物（Compound）
- 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
640 - 输出一致性： 固定（Fixed）
- 解释： 分子的向量表示
以下是模型的输出列（仅展示前10列）：
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| a1_000 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第0维度 |
| a1_001 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第1维度 |
| a1_002 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第2维度 |
| a1_003 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第3维度 |
| a1_004 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第4维度 |
| a1_005 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第5维度 |
| a1_006 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第6维度 |
| a1_007 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第7维度 |
| a1_008 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第8维度 |
| a1_009 | float | Signaturizer3D数据集化学（A）2D化学（A1）的第9维度 |
来源与部署
- 来源： 本地（Local）
- 来源类型： 外部（External）
- DockerHub： https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos2sbn
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储： [***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
2728 - 环境大小（Mb）：
1295 - 镜像大小（Mb）：
9468.76
计算性能（秒）：
- 10个输入：
32.35 - 100个输入：
102.84 - ***个输入：
-1（未测试）
参考文献
- 源代码： [***]
- 出版物： [***]
- 出版物类型： 同行评审
- 出版年份：
2024 - Ersilia贡献者： https://github.com/arnaucoma24
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%EF%BC%8C%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82**%E6%B3%A8%E6%84%8F%EF%BC%9A** Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用，请参考原始代码仓库和出版物。
使用方法
本地使用需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%EF%BC%8C%E6%89%A7%E8%A1%8C%E4%BB%A5%E4%B8%8B%E5%91%BD%E4%BB%A4%EF%BC%9A
bash# 获取模型 ersilia fetch eos2sbn # 启动服务 ersilia serve eos2sbn # 生成3条示例数据 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭服务 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是技术非营利组织，推动全球南方可持续研究。若模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia Model Hub；遇问题请https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%EF%BC%9B%E6%94%AF%E6%8C%81%E4%BD%BF%E5%91%BD%E5%8F%AF***%E3%80%82
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos2sbn:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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