ersiliaos/eos2zmb
ersiliaos
该镜像提供HDAC1抑制预测模型，基于ChEMBL数据和LazyQsar开发，可评估化合物对人类组蛋白去乙酰化酶1的抑制能力，助力HIV潜伏逆转及癌症、艾滋病领域的药物研发。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：7 个月前
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HDAC1抑制预测模型
镜像概述
本镜像包含用于预测人类组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）抑制作用的模型，旨在研究HIV潜伏逆转。模型基于ChEMBL目标325的pIC50数据（采用pIC50=7和8两个阈值），通过Ersilia的LazyQsar包开发，5折交叉验证的AUROC分别为0.89和0.91。模型于2023年9月27日纳入，最后打包时间为2025年11月20日。
核心功能
- 输入化合物信息，输出其对HDAC1抑制作用的概率（对应pIC50=7和8两个阈值）
- 提供固定维度的输出结果，包含两个分类得分列
- 支持批量处理，计算性能稳定（10/100/***输入的处理时间分别为65.74/58.41/649.67秒）
使用场景
- 生物医学研究：HIV潜伏逆转相关的药物筛选
- 化合物活性评估：快速预测化合物对HDAC1的抑制潜力
- 科研辅助工具：助力癌症、艾滋病领域的药物研发与机制研究
配置说明
标识符
- Ersilia标识符：
eos2zmb - Slug：
hdac1-inhibition
领域信息
- 任务：注释
- 子任务：活性预测
- 生物医学领域：癌症、艾滋病
- 目标生物：人类（Homo sapiens）
- 标签：HIV、Human、HDAC1
输入输出
- 输入：化合物（维度1）
- 输出：维度2，包含以下结果列：
名称 类型 方向 描述 hdac1_pic50_7 float high 基于pIC50=7阈值的HDAC1抑制分类得分 hdac1_pic50_8 float high 基于pIC50=8阈值的HDAC1抑制分类得分
资源与性能
- 模型大小：19 Mb
- 环境大小：7610 Mb
- 镜像大小：7527.14 Mb
部署与使用
需先安装Ersilia CLI工具，执行以下命令操作模型：
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos2zmb # 启动模型服务 ersilia serve eos2zmb # 生成3条数据的示例输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型并输出结果 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
参考与许可
- 源代码：https://github.com/ersilia-os/lazy-qsar
- 出版物：https://www.ebi.ac.uk/chembl/target_report_card/CHEMBL325/
- 许可：包使用GPL-3.0许可，模型使用GPL-3.0-or-later许可
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一家科技非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。若使用该模型，请引用Ersilia模型库，并在遇到问题时反馈。如需支持其使命，可考虑***。
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos2zmb:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"