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ersiliaos/eos39co
ersiliaos
Uni-Mol分子表示镜像是基于SE(3)等变Transformer架构的预训练模型，可捕捉分子3D信息，训练超过2亿个构象，输出512维表示嵌入，Ersilia标识符为eos39co，适用于分子特征化任务。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：1 个月前
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Uni-Mol分子表示
Uni-Mol提供了一种简单高效的SE(3)等变Transformer架构，用于预训练捕捉3D信息的分子表示。该模型在超过2亿个构象上进行训练，当前版本输出表示嵌入向量。本模型于2024年7月22日整合，最后打包时间为2026年4月14日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos39co - 别名：
unimol-representation
领域信息
- 任务：
Representation（表示学习） - 子任务：
Featurization（特征化） - 生物医学领域：
Any（通用） - 目标生物：
Any（通用） - 标签：
Fingerprint（指纹）
输入信息
- 输入类型：
Compound（化合物） - 输入维度：
1
输出信息
- 输出维度：
512 - 输出一致性：
Fixed（固定） - 解释：Uni-Mol表示嵌入向量
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| dim_000 | float | Uni-Mol嵌入的第0维 | |
| dim_001 | float | Uni-Mol嵌入的第1维 | |
| dim_002 | float | Uni-Mol嵌入的第2维 | |
| dim_003 | float | Uni-Mol嵌入的第3维 | |
| dim_004 | float | Uni-Mol嵌入的第4维 | |
| dim_005 | float | Uni-Mol嵌入的第5维 | |
| dim_006 | float | Uni-Mol嵌入的第6维 | |
| dim_007 | float | Uni-Mol嵌入的第7维 | |
| dim_008 | float | Uni-Mol嵌入的第8维 | |
| dim_009 | float | Uni-Mol嵌入的第9维 |
显示512列中的10列
来源与部署
- 来源：
Local（本地） - 来源类型：
External（外部） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos39co
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：[***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
183 - 环境大小（Mb）：
5330 - 镜像大小（Mb）：
5844.64
计算性能（秒）：
- 10个输入：
39.58 - 100个输入：
56.45 - ***个输入：
1156.61
参考资料
- 源代码：https://github.com/deepmodeling/Uni-Mol
- 论文：[***]
- 论文类型：
Preprint（预印本） - 发表年份：
2024 - Ersilia贡献者：https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-only%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia仅提供原始作者的模型访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或论文。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
通过以下命令从Ersilia模型 hub 获取模型：
bash# 从Ersilia模型hub获取模型 ersilia fetch eos39co
服务与运行
获取模型后，可按以下步骤启动服务、运行模型和关闭服务：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos39co # 生成示例输入文件（3个样本） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一家技术非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。
如果发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。运行过程中遇到任何问题，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
若想为我们的使命做出贡献，欢迎考虑***支持Ersilia！
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos39co:<标签>
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