ersiliaos/eos45di
ersiliaos
这是Ersilia Model Hub的eos45di模型，基于Enamine Hit Locator库训练，使用PCA、UMAP、t-SNE、TMAP算法对化合物进行2D投影，输出各方法的坐标，助力化学空间分析与可视化。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：30 天前
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基于Enamine Hit Locator训练的2D投影模型
本模型使用lazy-chemvis工具，以包含416K化合物的Enamine Hit Locator库作为参考化学空间，执行PCA、UMAP、t-SNE和TMAP投影。分子描述符采用ECFP4指纹（2048位）和RDKit理化描述符，每种投影方法返回两个坐标。该模型于2026年3月20日纳入Ersilia Model Hub，最后打包时间为2026年5月28日。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos45di - 别名:
lazychemvis-enamine-hl
领域
- 任务: 表示学习
- 子任务: 投影
- 生物医学领域: 通用
- 目标生物: 通用
- 标签: 嵌入
输入
- 输入类型: 化合物
- 输入维度: 1
输出
- 输出维度: 8
- 输出一致性: 固定
- 解释: 2D投影坐标（PCA、UMAP、tSNE、TMAP各两个维度）
以下是模型输出列详情：
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| pca_x | float | 参考化学空间上的第一主成分投影 |
| pca_y | float | 参考化学空间上的第二主成分投影 |
| tmap_x | float | 参考化学空间上的第一TMAP维度投影 |
| tmap_y | float | 参考化学空间上的第二TMAP维度投影 |
| tsne_x | float | 参考化学空间上的第一TSNE维度投影 |
| tsne_y | float | 参考化学空间上的第二TSNE维度投影 |
| umap_x | float | 参考化学空间上的第一UMAP维度投影 |
| umap_y | float | 参考化学空间上的第二UMAP维度投影 |
来源与部署
- 来源: 本地
- 来源类型: 内部
- DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos45di
- Docker架构: AMD64
- S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos45di.zip
资源消耗
- 模型大小: 195 Mb
- 环境大小: 8290 Mb
- 镜像大小: 8664.78 Mb
计算性能（秒）:
- 10个输入: 40.2
- 100个输入: 26.58
- ***个输入: 501.69
参考资料
- 源代码: https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 出版物: https://github.com/ersilia-os/lazy-chemvis
- 贡献者: https://github.com/Marina18
许可证
本包采用GPL-3.0许可证，模型采用MIT许可证。使用时请参考原始代码仓库及出版物。
使用方法
需先安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%EF%BC%8C%E5%86%8D%E6%89%A7%E8%A1%8C%E4%BB%A5%E4%B8%8B%E6%AD%A5%E9%AA%A4%EF%BC%9A
获取模型
bashersilia fetch eos45di
服务与运行
bash# 启动服务 ersilia serve eos45di # 生成示例输入（3个样本） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭服务 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是技术非营利组织，支持全球南方可持续研究。使用模型请引用Ersilia Model Hub，遇问题可提交issue，欢迎***。 ===END===
镜像拉取方式
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DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos45di:<标签>
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