ersiliaos/eos46ev
ersiliaos
该镜像提供结核分枝杆菌抑制剂预测模型，通过集成支持向量机、随机森林等多种算法识别对结核分枝杆菌有活性的分子，用于生物医学领域的药物研发相关研究。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：6 个月前
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结核分枝杆菌抑制剂预测
本模型利用ChEMBL25数据（目标ID 360、2111188及2366634）的集成数据识别对结核分枝杆菌有活性的分子，最终模型为堆叠模型，整合了支持向量机、随机森林、极端梯度提升和深度神经网络四种算法。
该模型于2022年6月28日纳入，最后打包时间为2025年12月4日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos46ev - 别名：
chemtb
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
活性预测 - 生物医学领域：
结核病 - 目标生物：
结核分枝杆菌 - 标签：
结核分枝杆菌、IC50、结核病、抗菌活性
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释： 结核分枝杆菌抑制概率（以5 μM为 cutoff 的 IC50 测量值）
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| proba_chemtb | 浮点数 | 高 | 抑制结核分枝杆菌生长的概率 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub： https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos46ev
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储： https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos46ev.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
109 - 环境大小（Mb）：
2193 - 镜像大小（Mb）：
2190.84
计算性能（秒）：
- 10个输入：
27.85 - 100个输入：
21.29 - ***个输入：
260.25
参考资料
- 源代码： http://cadd.zju.edu.cn/chemtb/
- 出版物： [***]
- 出版物类型：
同行评审 - 出版年份：
2021 - Ersilia贡献者： https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E6%97%A0%E7%89%B9%E5%AE%9A%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%EF%BC%88%E8%AF%A6%E8%A7%81LICENSE%EF%BC%89%E3%80%82
注意： Ersilia直接从原作者处提供模型的“原样”访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
可通过以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos46ev
然后，可按以下步骤服务、运行和关闭模型：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos46ev # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果您发现该模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E8%8B%A5%E5%9C%A8%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，欢迎考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos46ev:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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