ersiliaos/eos4djh
ersiliaos
使用Datamol包计算基本分子描述符（包括分子量、cLogP、氢键供体/受体等），适用于小分子库注释，不推荐用于QSAR建模。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：6 个月前
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Datamol基本分子描述符
使用Datamol包计算的基本分子描述符，包括分子量、亲脂性（cLogP）、氢键供体、氢键受体等。这些描述符通常用于注释小分子库。由于在大多数场景下可能过于简单，不推荐用于QSAR建模。
该模型于2024年11月09日整合，最后打包于2025年12月24日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos4djh - 别名：
datamol-basic-descriptors
领域
- 任务：
Representation（表征） - 子任务：
Featurization（特征化） - 生物医学领域：
Any（任意） - 目标生物：
Any（任意） - 标签：
Descriptor（描述符）
输入
- 输入类型：
Compound（化合物） - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
22 - 输出一致性：
Fixed（固定） - 解释：基本分子描述符。部分为浮点数，部分为计数。
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| mw | float | high | 化合物的分子量 |
| fsp3 | float | high | sp3杂化碳的比例 |
| n_lipinski_hba | integer | high | Lipinski氢键受体数量 |
| n_lipinski_hbd | integer | high | Lipinski氢键供体数量 |
| n_rings | integer | high | 化合物中的环数量 |
| n_hetero_atoms | integer | high | 化合物中的杂原子数量 |
| n_heavy_atoms | integer | high | 化合物中非氢重原子数量 |
| n_rotatable_bonds | integer | high | 化合物中的可旋转键数量 |
| n_radical_electrons | integer | high | 化合物中的自由基电子数量 |
| tpsa | float | high | 化合物的拓扑极性表面积 |
显示22列中的10列
来源与部署
- 来源：
Local（本地） - 来源类型：
External（外部） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos4djh
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos4djh.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1 - 环境大小（Mb）：
784 - 镜像大小（Mb）：
741.5
计算性能（秒）：
- 10个输入：
27.9 - 100个输入：
17.73 - ***个输入：
70.79
参考文献
- 源代码：[***]
- 出版物：https://github.com/datamol-io/datamol
- 出版物类型：
Other（其他） - 出版年份：
2024 - Ersilia贡献者：https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8Apache-2.0%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型，"按原样"授予访问权限。如果在研究中使用该模型，请参考原始代码库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需要安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
可使用以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos4djh
然后，可以按以下方式服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos4djh # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E5%A6%82%E6%9E%9C%E5%9C%A8%E5%B0%9D%E8%AF%95%E8%BF%90%E8%A1%8C%E6%97%B6%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos4djh:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"