ersiliaos/eos4jcv
ersiliaos
该镜像提供Chemical Checker Signaturizer 3D E1-5模型，用于生成化合物的生物活性特征向量，支持小分子的表示学习与特征化，适用于生物医学领域的相关研究。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：5 个月前
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Chemical Checker Signaturizer 3D E1-5
基于Chemical Checker生物活性签名（可通过eos4u6p获取），作者利用超过100万种化合物的立体异构体与生物活性之间的关系，训练了具有立体化学感知的签名生成器，以更好地描述小分子的生物活性特性。该模型对应Chemical Checker空间E1、E2、E3、E4和E5。模型于2025年6月25日纳入，最后打包于2025年12月30日。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos4jcv - 别名:
cc-signaturizer-3d-e
领域
- 任务:
表示学习 - 子任务:
特征化 - 生物医学领域:
通用 - 目标生物:
通用 - 标签:
描述符,生物活性谱,嵌入
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
640 - 输出一致性:
固定 - 解释: 分子的向量表示
以下是模型的输出列（展示前10项）：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| e1_000 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第0维度 | |
| e1_001 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第1维度 | |
| e1_002 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第2维度 | |
| e1_003 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第3维度 | |
| e1_004 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第4维度 | |
| e1_005 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第5维度 | |
| e1_006 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第6维度 | |
| e1_007 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第7维度 | |
| e1_008 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第8维度 | |
| e1_009 | float | Signaturizer3D数据集临床（E）治疗领域（E1）的第9维度 |
来源与部署
- 来源:
本地 - 来源类型:
外部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos4jcv
- Docker架构:
AMD64,ARM64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos4jcv.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）:
2728 - 环境大小（Mb）:
1295 - 镜像大小（Mb）:
9468.77
计算性能（秒）:
- 10个输入:
32.33 - 100个输入:
99.74 - ***个输入:
-1
参考文献
- 源代码: [***]
- 出版物: [***]
- 出版物类型:
同行评审 - 出版年份:
2024 - Ersilia贡献者: https://github.com/arnaucoma24
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
bash# 从Ersilia模型 hub 获取模型 ersilia fetch eos4jcv
服务与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos4jcv # 生成示例输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos4jcv:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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