ersiliaos/eos4k4f
ersiliaos
该Docker镜像提供分子在不同化学抽象水平的表示生成功能，可输出规范SMILES、ChEMBL标准化母体、无立体化学形式、Murcko核心骨架和通用骨架，适用于化合物结构分析与标准化处理。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明 · 点击收起说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
小分子标准化模型
该模型输出分子在不同化学抽象水平的表示，范围从完整的规范结构到ChEMBL标准化母体、无立体化学形式、Murcko核心骨架，以及去除原子特定标识的通用骨架。模型于2026年1月8日整合，最后打包时间为2026年3月19日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos4k4f - 简称：
standardization
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
性质计算或预测 - 生物医学领域：
通用 - 目标生物：
通用 - 标签：
化合物生成
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
5 - 输出一致性：
固定 - 解释：模型为给定分子输出多个化学抽象水平的表示。
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| canonical_smiles | string | 分子的规范SMILES | |
| standardized_smiles | string | ChEMBL标准化的母体SMILES | |
| flattened_smiles | string | 无立体化学的标准化SMILES | |
| murcko_scaffold | string | 分子的Bemis–Murcko骨架 | |
| generic_scaffold | string | 骨架的通用（原子类型无关）版本 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
内部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos4k4f
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos4k4f.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1 - 环境大小（Mb）：
791 - 镜像大小（Mb）：
740.12
计算性能（秒）：
- 10个输入：
37.55 - 100个输入：
30.88 - ***个输入：
90.59
参考文献
- 源代码：https://github.com/chembl/ChEMBL_Structure_Pipeline
- 出版物：https://doi.org/10.1186/s***-020-00456-1
- 出版物类型：
同行评审 - 出版年份：
2025 - Ersilia贡献者：https://github.com/arnaucoma24
许可证
本软件包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia按"原样"提供模型访问，直接来自原始作者。如果在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
通过以下命令从Ersilia模型中心获取模型：
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos4k4f
服务、运行与关闭模型
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos4k4f # 生成示例文件（3个输入） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E5%A6%82%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，欢迎考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos4k4f:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"