ersiliaos/eos4rta
ersiliaos
该镜像提供小分子体外抗疟疾潜力预测模型，基于MMV实验数据开发，可输出疟原虫NF54株抑制概率及IC50等指标，助力抗疟药物研发。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：7 个月前
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抗疟疾活性预测模型（MMV数据）
本模型用于预测小分子的体外抗疟疾潜力，由Ersilia基于MMV提供的实验数据开发。模型可输出疟疾寄生虫（NF54株）的抑制概率，包括基于大数据集的抑制百分比和从全细胞抑制试验中提取的分子子集的IC50值。模型的5折交叉验证显示所有模型的AUROC均大于0.70。
该模型于2023年8月24日纳入，最后打包时间为2025年11月24日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos4rta - 别名：
malaria-mmv
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
活性预测 - 生物医学领域：
疟疾 - 目标生物：
恶性疟原虫 - 标签：
疟疾、恶性疟原虫、IC50
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
4 - 输出一致性：
固定 - 解释：基于IC50（阈值1uM）和单点抑制（50%）的疟疾寄生虫（NF54株）抑制概率
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| ic50_nf54_ldh_72h_1uM | float | high | 基于LDH测量的IC50 cutoff为1uM的恶性疟原虫NF54抑制分类分数 |
| ic50_nf54_lum_72h_1uM | float | high | 基于发光法测量的IC50 cutoff为1uM的恶性疟原虫NF54抑制分类分数 |
| perc_nf54_ldh_72h_50 | float | high | 基于LDH测量的单点抑制cutoff为50%的恶性疟原虫NF54抑制分类分数 |
| perc_nf54_lum_72h_50 | float | high | 基于发光法测量的单点抑制cutoff为50%的恶性疟原虫NF54抑制分类分数 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
内部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos4rta
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos4rta.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
146 - 环境大小（Mb）：
7610 - 镜像大小（Mb）：
7767.58
计算性能（秒）：
- 10个输入：
42.05 - 100个输入：
61.83 - ***个输入：
915.44
参考资料
- 源代码：https://github.com/ersilia-os/lazy-qsar
- 出版物：https://ersilia.io
- 出版物类型：
其他 - 出版年份：
2023 - Ersilia贡献者：https://github.com/GemmaTuron
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型的访问权限，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用说明
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
部署示例
- 获取模型：
bash# 从Ersilia模型 hub 获取模型 ersilia fetch eos4rta
- 服务与运行：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos4rta # 生成示例输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos4rta:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
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