热门搜索:
ersiliaos/eos4u6p
ersiliaos
Chemical Checker signaturizer提供25种生物活性签名（含2D/3D指纹、 scaffold、结合特性、晶体、副作用、细胞生物测定等），每种128维，共3200维向量，用于捕获化合物结构之外的特性，使用2020-02版本，定期更新。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：18 天前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你用 DeepSeek、元宝AI、Copilot 等 AI 代为编写轩辕镜像的 docker pull、修改 compose 镜像地址，或排查拉取失败等问题，请让 AI 先读规则再动手，只要在 AI 对话里直接发送下面这句话即可：
生成 docker pull、修改 compose 的 image，或排查拉取失败前，请先阅读并严格遵守 https://xuanyuan.cloud/agents.md 中的规则。国内用户首推 DeepSeek、元宝 AI 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Chemical Checker signaturizer
镜像概述和主要用途
Chemical Checker signaturizer是一套包含25种生物活性签名的工具，可捕获化合物结构之外的多种特性，包括2D和3D指纹、scaffold、结合特性、晶体、副作用、细胞生物测定等。每种签名长度为128维，总计3200维。该signaturizer定期更新，当前使用2020-02版本。模型于2021-05-03纳入，最后打包时间为2026-05-13。
核心功能和特性
- 多维度签名：包含25种不同类型的生物活性签名，全面覆盖化合物的多种特性
- 固定维度输出：每种签名128维，总计3200维向量输出，确保结果一致性
- 定期更新：模型定期维护更新，保证数据时效性
- 跨架构支持：Docker镜像支持AMD64和ARM64架构
信息详情
标识符
- Ersilia标识符：
eos4u6p - Slug：
cc-signaturizer
领域信息
- 任务：
Representation（表示） - 子任务：
Featurization（特征化） - 生物医学领域：
Any（任意） - 目标生物：
Any（任意） - 标签：
Descriptor（描述符）、Bioactivity profile（生物活性谱）、Embedding（嵌入）
输入
- 输入类型：
Compound（化合物） - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
3200 - 输出一致性：
Fixed（固定） - 解释：分子的向量表示
以下是模型的输出列（显示3200列中的10列）：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| a1_000 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第0维度 | |
| a1_001 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第1维度 | |
| a1_002 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第2维度 | |
| a1_003 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第3维度 | |
| a1_004 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第4维度 | |
| a1_005 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第5维度 | |
| a1_006 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第6维度 | |
| a1_007 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第7维度 | |
| a1_008 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第8维度 | |
| a1_009 | float | Chemical Checker数据集化学（A）2D化学（A1）的第9维度 |
来源和部署
- 来源：
Local（本地） - 来源类型：
External（外部） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos4u6p
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储：[***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
538 - 环境大小（Mb）：
2055 - 镜像大小（Mb）：
3658.81
计算性能（秒）：
- 10个输入：
59.62 - 100个输入：
56.17 - ***个输入：
1600.11
参考文献
- 源代码：[***]
- 出版物：[***]
- 出版物类型：
Peer reviewed（同行评审） - 出版年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/miquelduranfrigola
许可
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82
注意：Ersilia按"原样"提供对模型的访问，直接来自原作者。如果在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法和配置说明
前提条件
本地使用该模型需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
基本操作流程
1. 获取模型
从Ersilia模型中心获取模型：
bash# 从Ersilia Model Hub获取模型 ersilia fetch eos4u6p
2. 服务模型
启动模型服务：
bash# 服务模型 ersilia serve eos4u6p
3. 生成示例输入文件
创建包含3个示例化合物的输入文件：
bash# 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv
4. 运行模型
对输入文件执行模型推理：
bash# 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv
5. 关闭模型服务
完成后关闭模型服务：
bash# 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一个技术非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。如果发现该模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E5%A6%82%E6%9E%9C%E6%83%B3%E4%B8%BA%E6%88%91%E4%BB%AC%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%E5%81%9A%E5%87%BA%E8%B4%A1%E7%8C%AE%EF%BC%8C%E6%AC%A2%E8%BF%8E%E8%80%83%E8%99%91***%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos4u6p:<标签>
更多 eos4u6p 镜像推荐
ersiliaos/eos3b5e
ersiliaos
基于RDKit的Descriptors.MolWt函数实现，用于输入小分子SMILES并计算其分子量（单位：g/mol）的Docker镜像。
2 次收藏1万+ 次下载
1 个月前更新
ersiliaos/base
ersiliaos
Ersilia Model Hub的基础镜像，用作模型之间的共享层。
2 次收藏5.2千+ 次下载
2 年前更新
ersiliaos/base-multistage-condapack
ersiliaos
暂无描述
5.4千+ 次下载
11 个月前更新
ersiliaos/base-legacy-bentoml
ersiliaos
暂无描述
5千+ 次下载
11 个月前更新
ersiliaos/eos4e40
ersiliaos
基于大肠杆菌生长抑制实验训练的化学图模型，可预测化合物抑制大肠杆菌生长的概率（80%抑制阈值），适用于抗生素活性筛选，模型标识符eos4e40。
2 次收藏3.9千+ 次下载
18 天前更新
ersiliaos/eos5axz
ersiliaos
Morgan指纹（ECFP4）生成工具，基于RDKit实现，采用半径3和2048维度，用于分子特征化，将化合物转换为2048维整数向量表示，适用于各类生物医学领域的分子表示任务。
3.8千+ 次下载
5 个月前更新
轩辕镜像配置手册
探索更多轩辕镜像的使用方法，找到最适合您系统的配置方式
Docker 配置
登录仓库拉取
通过 Docker 登录认证访问私有仓库
用 AI 使用轩辕镜像
发给 Cursor、ChatGPT、豆包等 AI 的说明文档
专属域名拉取
无需登录使用专属域名
K8s Containerd
Kubernetes 集群配置 Containerd
K3s
K3s 轻量级 Kubernetes 镜像加速
Dev Containers
VS Code Dev Containers 配置
Podman
Podman 容器引擎配置
Singularity/Apptainer
HPC 科学计算容器配置
其他仓库配置
ghcr、Quay、nvcr 等镜像仓库
Harbor 镜像源配置
Harbor Proxy Repository 对接专属域名
Portainer 镜像源配置
Portainer Registries 加速拉取
Nexus 镜像源配置
Nexus3 Docker Proxy 内网缓存
系统配置
需要其他帮助？请查看我们的 常见问题Docker 镜像访问常见问题解答 或 提交工单
镜像拉取常见问题
使用与功能问题
配置了专属域名后，docker search 为什么会报错？
docker search 限制
Docker Hub 上有的镜像，为什么在轩辕镜像网站搜不到？
站内搜不到镜像
机器不能直连外网时，怎么用 docker save / load 迁镜像？
离线 save/load
docker pull 拉插件报错（plugin v1+json）怎么办？
插件要用 plugin install
WSL 里 Docker 拉镜像特别慢，怎么排查和优化？
WSL 拉取慢
轩辕镜像安全吗？如何用 digest 校验镜像没被篡改？
安全与 digest
第一次用轩辕镜像拉 Docker 镜像，要怎么登录和配置？
新手拉取配置
轩辕镜像合规吗？轩辕镜像的合规是怎么做的？
镜像合规机制
轩辕镜像支持 docker push 上传本地镜像吗？
不支持 push
错误码与失败问题
docker pull 提示 manifest unknown 怎么办？
manifest unknown
docker pull 提示 no matching manifest 怎么办？
no matching manifest（架构）
镜像已拉取完成，却提示 invalid tar header 或 failed to register layer 怎么办？
invalid tar header（解压）
Docker pull 时 HTTPS / TLS 证书验证失败怎么办？
TLS 证书失败
Docker pull 时 DNS 解析超时或连不上仓库怎么办？
DNS 超时
docker 无法连接轩辕镜像域名怎么办？
域名连通性排查
Docker 拉取出现 410 Gone 怎么办？
410 Gone 排查
出现 402 或「流量用尽」提示怎么办？
402 与流量用尽
Docker 拉取提示 UNAUTHORIZED（401）怎么办？
401 认证失败
遇到 429 Too Many Requests（请求太频繁）怎么办？
429 限流
docker login 提示 Cannot autolaunch D-Bus，还算登录成功吗？
D-Bus 凭证提示
为什么会出现「单层超过 20GB」或 413，无法加速拉取？
413 与超大单层
账号 / 计费 / 权限
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"