ersiliaos/eos5smc
ersiliaos
该镜像提供基于GROVER transformer的模型，用于预测化合物在Tox21毒性面板的12种毒性通路活性，属于MoleculeNet基准数据集的一部分。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明 · 点击收起说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Tox21面板化合物活性预测模型
本模型可预测化合物在Tox21毒性面板中的活性，该面板包含12种毒性通路，是MoleculeNet基准数据集的一部分。模型采用GROVER transformer训练（详情见eos7w6n或grover-embedding关于GROVER分子特征化步骤的说明）。
模型于2022年7月12日纳入Ersilia模型库，最后打包时间为2026年3月10日。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos5smc - 别名:
grover-tox21
领域
- 任务:
注释 - 子任务:
活性预测 - 生物医学领域:
ADMET - 目标生物:
智人（Homo sapiens） - 标签:
Tox21,毒性,化学图模型
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
12 - 输出一致性:
固定 - 解释: 针对12个生物靶点的毒性测量结果
以下是模型的输出列（显示12列中的10列）：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| nr_ar | float | high | Tox21靶点nr_ar的抑制概率 |
| nr_ar_lbd | float | high | Tox21靶点nr_ar_lbd的抑制概率 |
| nr_ahr | float | high | Tox21靶点nr_ahr的抑制概率 |
| nr_aromatase | float | high | Tox21靶点nr_aromatase的抑制概率 |
| nr_er | float | high | Tox21靶点nr_er的抑制概率 |
| nr_er_lbd | float | high | Tox21靶点nr_er_lbd的抑制概率 |
| nr_ppar_gamma | float | high | Tox21靶点nr_ppar_gamma的抑制概率 |
| sr_are | float | high | Tox21靶点sr_are的抑制概率 |
| sr_atad5 | float | high | Tox21靶点sr_atad5的抑制概率 |
| sr_hse | float | high | Tox21靶点sr_hse的抑制概率 |
来源与部署
- 来源:
本地 - 来源类型:
外部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos5smc
- Docker架构:
AMD64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos5smc.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）:
1310 - 环境大小（Mb）:
2405 - 镜像大小（Mb）:
6358.64
计算性能（秒）:
- 10个输入:
34.9 - 100个输入:
159.91 - ***个输入:
-1（未测试）
参考文献
- 源代码: https://github.com/tencent-ailab/grover
- 出版物: https://arxiv.org/abs/2007.02835
- 出版物类型:
预印本 - 出版年份:
2020 - Ersilia贡献者: https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
本地使用模型需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
模型获取
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos5smc
模型服务与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos5smc # 生成示例输入文件（3条数据） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos5smc:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"