ersiliaos/eos77w8
ersiliaos
该模型使用SIDER数据库和GROVER transformer预测分子的潜在药物不良反应（ADR），输出27类ADR的概率，适用于药物安全性评估和ADMET研究。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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药物不良反应预测模型
镜像概述和主要用途
本模型用于预测分子的潜在药物不良反应（ADR），基于SIDER数据库（MoleculeNet）训练，该数据库包含已上市药物及其ADR描述对。模型采用GROVER transformer进行分子特征化（详见eos7w6n或grover-embedding）。模型于2021-05-12纳入，最后打包时间为2026-03-10。
核心功能和特性
- ADR预测：对输入分子预测27类药物不良反应的概率
- 分子特征化：基于GROVER transformer提取分子特征
- 固定输出：输出维度固定为27，涵盖多个器官系统的不良反应类别
- 概率量化：以概率值表示各ADR发生的可能性，便于风险评估
使用场景和适用范围
- 药物研发：早期药物候选分子的安全性评估
- ADMET研究：药物吸收、分布、代谢、排泄和毒性特性研究
- 毒理学筛选：化合物潜在副作用的高通量筛选
- 目标生物：人类（Homo sapiens）
详细信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos77w8 - 别名：
grover-sider
领域分类
- 任务：
注释（Annotation） - 子任务：
活性预测（Activity prediction） - 生物医学领域：
ADMET - 标签：
毒性（Toxicity）、MoleculeNet、副作用（Side effects）
输入输出
- 输入：
化合物（Compound） - 输入维度：
1 - 输出维度：
27 - 输出一致性：
固定（Fixed） - 解释：预测的ADR分为27个组别
输出列说明：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| hepatobiliary_disorders | float | high | SIDER定义的肝胆系统疾病副作用发生概率 |
| metabolism_nutrition_disorders | float | high | SIDER定义的代谢与营养障碍副作用发生概率 |
| product_issues | float | high | SIDER定义的产品相关问题副作用发生概率 |
| eye_disorders | float | high | SIDER定义的眼部疾病副作用发生概率 |
| investigations | float | high | SIDER定义的检查异常副作用发生概率 |
| musculoskeletal_connective_tissue_disorders | float | high | SIDER定义的肌肉骨骼和结缔组织疾病副作用发生概率 |
| gastrointestinal_disorders | float | high | SIDER定义的胃肠道疾病副作用发生概率 |
| social_circumstances | float | high | SIDER定义的社会环境相关副作用发生概率 |
| immune_system_disorders | float | high | SIDER定义的免疫系统疾病副作用发生概率 |
| reproductive_system_breast_disorders | float | high | SIDER定义的生殖系统和乳腺疾病副作用发生概率 |
显示27列中的10列
资源与部署
- 来源：
Local - 来源类型：
External - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos77w8
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos77w8.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1323 - 环境大小（Mb）：
2406 - 镜像大小（Mb）：
6394.66
计算性能（秒）：
- 10个输入：
35.52 - 100个输入：
161.37 - ***个输入：
-1（未测试）
参考与许可
- 源代码：https://github.com/tencent-ailab/grover
- 论文：https://arxiv.org/abs/2007.02835
- 论文类型：
预印本（Preprint） - 发表年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/Amna-28
许可：
- 本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF
- 包内模型采用MIT许可
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型，仅供参考使用。若在研究中使用本模型，请参考原始代码库和/或论文。
使用方法
前提条件
需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia
基本操作
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos77w8 # 启动模型服务 ersilia serve eos77w8 # 生成示例输入文件（3个样本） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型预测 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos77w8:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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Linux服务器
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