ersiliaos/eos78ao
ersiliaos
这是一个包含约1613个化学描述符的模型，可快速计算分子特征并处理更大分子，通过DrugBank训练的填充器处理空值后输出1458个特征向量，适用于分子表征场景。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：8 个月前
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Mordred化学描述符
该模型包含约1613个化学描述符，涵盖RDKit和原始模块。与知名的PaDEL-Descriptors（见eos7asg）相比，计算时间更短且能处理更大分子。本实现使用基于DrugBank训练的填充器填补空值，并消除频繁空列，最终得到1458个特征。
该模型于2021年9月28日整合，最后打包于2025年10月22日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos78ao - 别名：
mordred
领域
- 任务： 表征
- 子任务： 特征化
- 生物医学领域： 通用
- 目标生物： 通用
- 标签： 描述符
输入
- 输入类型： 化合物
- 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
1458 - 输出一致性： 固定
- 解释： 分子的向量表示
以下是模型的输出列（展示1458列中的10列）：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| abc | float | high | 原子-键连接性指数 |
| abcgg | float | high | Graovac-Ghorbani原子-键连接性指数 |
| nacid | float | high | 酸性基团计数 |
| nbase | float | high | 碱性基团计数 |
| spabs_a | float | high | 邻接矩阵的SpAbs |
| spmax_a | float | high | 邻接矩阵的SpMax |
| spdiam_a | float | high | 邻接矩阵的SpDiam |
| spad_a | float | high | 邻接矩阵的SpAD |
| spmad_a | float | high | 邻接矩阵的SpMAD |
| logee_a | float | high | 邻接矩阵的LogEE |
来源与部署
- 来源： 本地
- 来源类型： 外部
- DockerHub： https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos78ao
- Docker架构：
AMD64、ARM64 - S3存储： https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos78ao.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
319 - 环境大小（Mb）：
830 - 镜像大小（Mb）：
1680.11
计算性能（秒）：
- 10个输入：
28.95 - 100个输入：
35.47 - ***个输入：
965.29
参考资料
- 源代码： https://github.com/mordred-descriptor/mordred
- 出版物： [***]
- 出版物类型： 同行评审
- 出版年份：
2018 - Ersilia贡献者： https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8BSD-3-Clause%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意： Ersilia直接从原作者处提供模型访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
部署步骤
-
获取模型
从Ersilia模型 hub 获取模型：bashersilia fetch eos78ao -
服务与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos78ao # 生成示例输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果该模型对您有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。若运行时遇到问题，请随时https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
若想支持我们的使命，欢迎https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos78ao:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
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