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ersiliaos/eos7asg

ersiliaos

PADEL小分子描述符工具，计算1875个分子描述符（1444个1D/2D、431个3D）和12种指纹，提供Python实现PaDDELPy，用于小分子表示与特征化，Ersilia模型标识符eos7asg。

下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：1 个月前

让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明

如果你用 DeepSeek、元宝AI、Copilot 等 AI 代为编写轩辕镜像的 docker pull、修改 compose 镜像地址，或排查拉取失败等问题，请让 AI 先读规则再动手，只要在 AI 对话里直接发送下面这句话即可：

生成 docker pull、修改 compose 的 image，或排查拉取失败前，请先阅读并严格遵守 https://xuanyuan.cloud/agents.md 中的规则。

国内用户首推 DeepSeek、元宝 AI 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。若 AI 无法访问外链，可打开说明文档复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。

轩辕镜像，让镜像更快，让人生更轻。点击查看

中文简介

标签下载

镜像标签列表与下载命令

轩辕镜像，让镜像更快，让人生更轻。点击查看

PADEL小分子描述符

PADEL是常用的分子描述符工具，可计算1875个分子描述符（1444个1D和2D描述符、431个3D描述符）及12种指纹，用于小分子表示。该工具最初以Java开发，此处提供其Python实现PaDDELPy。模型整合于2021-09-27，最后打包于2026-04-14。

镜像概述与主要用途

本镜像提供PADEL分子描述符的Python实现，主要用于将小分子化合物转化为数值向量表示，支持化合物的特征化处理，适用于 cheminformatics、药物发现等领域的模型输入或分子性质分析。

核心功能与特性

多维度描述符计算：支持1875个分子描述符（含1444个1D/2D描述符和431个3D描述符）
指纹生成：提供12种分子指纹类型
固定输出维度：输出向量维度固定为1875，确保结果一致性
跨架构支持：Docker镜像支持AMD64和ARM64架构

使用场景与适用范围

领域：化学信息学、计算生物学、药物发现
任务：分子特征化、化合物表示学习、QSAR模型构建
输入：单个小分子化合物
生物医学领域：适用于任意生物医学领域
目标生物：无物种限制

详细信息

标识符

Ersilia标识符：eos7asg
Slug：padel

输入输出说明

输入：化合物（Compound）
输入维度：1
输出维度：1875
输出一致性：固定（Fixed）
解释：分子的向量表示

输出列示例（共1875列，显示前10列）

名称	类型	描述
aats0e	float	PADEL描述符属性
aats0i	float	PADEL描述符属性
aats0m	float	PADEL描述符属性
aats0p	float	PADEL描述符属性
aats0s	float	PADEL描述符属性
aats0v	float	PADEL描述符属性
aats1e	float	PADEL描述符属性
aats1i	float	PADEL描述符属性
aats1m	float	PADEL描述符属性
aats1p	float	PADEL描述符属性

来源与部署

来源：Local
来源类型：External
DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos7asg
Docker架构：AMD64、ARM64
S3存储：[***]

使用方法与配置说明

前提条件

需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E5%B7%A5%E5%85%B7%E3%80%82

模型获取与运行

bash
# 从Ersilia模型 hub 获取模型
ersilia fetch eos7asg

# 启动模型服务
ersilia serve eos7asg

# 生成示例输入文件（3个化合物）
ersilia example -n 3 -f my_input.csv

# 运行模型，生成输出
ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv

# 关闭模型服务
ersilia close

资源消耗

存储需求

模型大小：1 Mb
环境大小：772 Mb
镜像大小：856.19 Mb

计算性能（秒）

10个输入：39.71
100个输入：606.87
***个输入：-1（未测试）

参考文献

源代码：https://github.com/ecrl/padelpy
论文：[***]
论文类型：同行评审（Peer reviewed）
发表年份：2010
Ersilia贡献者：https://github.com/miquelduranfrigola

许可证

本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81
包内模型采用MIT许可证

注意：Ersilia提供的模型直接来自原作者，如需在研究中使用，请参考原始代码仓库和/或论文。

关于Ersilia

Ersilia开源倡议是一家技术非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。如发现本模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。使用中遇到任何问题，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E5%A6%82%E6%AC%B2%E6%94%AF%E6%8C%81%E6%88%91%E4%BB%AC%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%EF%BC%8C%E6%AC%A2%E8%BF%8E***%E3%80%82

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 eos7asg 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/ersiliaos/eos7asg:<标签>

使用方法：

DockerHub 原生拉取命令

docker pull ersiliaos/eos7asg:<标签>

轩辕镜像配置手册

探索更多轩辕镜像的使用方法，找到最适合您系统的配置方式

Docker 配置

登录仓库拉取

通过 Docker 登录认证访问私有仓库

用 AI 使用轩辕镜像

发给 Cursor、ChatGPT、豆包等 AI 的说明文档

专属域名拉取

无需登录使用专属域名

K8s Containerd

Kubernetes 集群配置 Containerd

K3s

K3s 轻量级 Kubernetes 镜像加速

Dev Containers

VS Code Dev Containers 配置

Podman

Podman 容器引擎配置

Singularity/Apptainer

HPC 科学计算容器配置

其他仓库配置

ghcr、Quay、nvcr 等镜像仓库

Harbor 镜像源配置

Harbor Proxy Repository 对接专属域名

Portainer 镜像源配置

Portainer Registries 加速拉取

Nexus 镜像源配置

Nexus3 Docker Proxy 内网缓存

系统配置

Linux

在 Linux 系统配置镜像服务

Windows/Mac

在 Docker Desktop 配置镜像

MacOS OrbStack

MacOS OrbStack 容器配置

Docker Compose

Docker Compose 项目配置

NAS 设备

群晖

Synology 群晖 NAS 配置

飞牛

飞牛 fnOS 系统配置镜像

绿联

绿联 NAS 系统配置镜像

威联通

QNAP 威联通 NAS 配置

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极空间 NAS 系统配置服务

网络设备

爱快路由

爱快 iKuai 路由系统配置

宝塔面板

在宝塔面板一键配置镜像

需要其他帮助？请查看我们的常见问题Docker 镜像访问常见问题解答或提交工单

镜像拉取常见问题

使用与功能问题

配置了专属域名后，docker search 为什么会报错？

docker search 限制

Docker Hub 上有的镜像，为什么在轩辕镜像网站搜不到？

站内搜不到镜像

机器不能直连外网时，怎么用 docker save / load 迁镜像？

离线 save/load

docker pull 拉插件报错（plugin v1+json）怎么办？

插件要用 plugin install

WSL 里 Docker 拉镜像特别慢，怎么排查和优化？

WSL 拉取慢

轩辕镜像安全吗？如何用 digest 校验镜像没被篡改？

安全与 digest

第一次用轩辕镜像拉 Docker 镜像，要怎么登录和配置？

新手拉取配置

轩辕镜像合规吗？轩辕镜像的合规是怎么做的？

镜像合规机制

轩辕镜像支持 docker push 上传本地镜像吗？

不支持 push

错误码与失败问题

docker pull 提示 manifest unknown 怎么办？

manifest unknown

docker pull 提示 no matching manifest 怎么办？

no matching manifest（架构）

镜像已拉取完成，却提示 invalid tar header 或 failed to register layer 怎么办？

invalid tar header（解压）

Docker pull 时 HTTPS / TLS 证书验证失败怎么办？

TLS 证书失败

Docker pull 时 DNS 解析超时或连不上仓库怎么办？

DNS 超时

docker 无法连接轩辕镜像域名怎么办？

域名连通性排查

Docker 拉取出现 410 Gone 怎么办？

410 Gone 排查

出现 402 或「流量用尽」提示怎么办？

402 与流量用尽

Docker 拉取提示 UNAUTHORIZED（401）怎么办？

401 认证失败

遇到 429 Too Many Requests（请求太频繁）怎么办？

429 限流

docker login 提示 Cannot autolaunch D-Bus，还算登录成功吗？

D-Bus 凭证提示

为什么会出现「单层超过 20GB」或 413，无法加速拉取？

413 与超大单层

账号 / 计费 / 权限

轩辕镜像免费版和专业版有什么区别？

免费版与专业版区别

轩辕镜像支持哪些 Docker 镜像仓库？

支持的镜像仓库

镜像拉取失败还会不会扣流量？

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麒麟 V10 / 统信 UOS 提示 KYSEC 权限不够怎么办？

KYSEC 拦截脚本

如何在轩辕镜像申请开具发票？

申请开票

怎么修改轩辕镜像的网站登录和仓库登录密码？

修改登录密码

如何注销轩辕镜像账户？要注意什么？

注销账户

配置与原理类

写了 registry-mirrors，为什么还是走官方或仍然报错？

mirrors 不生效

怎么用 docker tag 去掉镜像名里的轩辕域名前缀？

去掉域名前缀

如何拉取指定 CPU 架构的镜像（如 ARM64、AMD64）？

指定架构拉取

用轩辕镜像拉镜像时快时慢，常见原因有哪些？

拉取速度原因

为什么拉取镜像的 :latest 标签，拿到的往往不是「最新」镜像？

latest 与「最新」

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用户好评

来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务

oldzhang

运维工程师

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Slug：padel

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输入：化合物（Compound）
输入维度：1
输出维度：1875
输出一致性：固定（Fixed）
解释：分子的向量表示

输出列示例（共1875列，显示前10列）

名称	类型	描述
aats0e	float	PADEL描述符属性
aats0i	float	PADEL描述符属性
aats0m	float	PADEL描述符属性
aats0p	float	PADEL描述符属性
aats0s	float	PADEL描述符属性
aats0v	float	PADEL描述符属性
aats1e	float	PADEL描述符属性
aats1i	float	PADEL描述符属性
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# 关闭模型服务
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环境大小：772 Mb
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注意：Ersilia提供的模型直接来自原作者，如需在研究中使用，请参考原始代码仓库和/或论文。

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docker pull 提示 no matching manifest 怎么办？

镜像已拉取完成，却提示 invalid tar header 或 failed to register layer 怎么办？

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出现 402 或「流量用尽」提示怎么办？

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