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eNTRy规则Docker镜像用于预测革兰氏阴性菌中的化合物积累，基于低球状性(≤0.25)、低旋转键数量(≤5)和存在伯胺基团三个标准，助力抗菌化合物设计与渗透性优化。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：24 天前
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如果你用 DeepSeek、元宝AI、Copilot 等 AI 代为编写轩辕镜像的 docker pull、修改 compose 镜像地址，或排查拉取失败等问题，请让 AI 先读规则再动手，只要在 AI 对话里直接发送下面这句话即可：
生成 docker pull、修改 compose 的 image，或排查拉取失败前，请先阅读并严格遵守 https://xuanyuan.cloud/agents.md 中的规则。国内用户首推 DeepSeek、元宝 AI 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
革兰氏阴性菌的eNTRy规则
eNTRy规则是一套用于预测化合物在革兰氏阴性菌中积累的三个简单标准。这些规则源自大肠杆菌中化合物积累的大型数据集，已被证明可有效指导设计具有改善渗透性和在革兰氏阴性菌中积累能力的化合物。eNTRy规则指出，化合物若具备以下特性，则更可能在革兰氏阴性菌中积累：(1)低球状性(≤0.25)，(2)低旋转键数量(≤5)，以及(3)存在伯胺基团。
该模型于2025年12月04日整合，最后打包于2026年01月23日。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos7ike - 简称：
entry-rules
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
活性预测 - 生物医学领域：
抗菌耐药性 - 目标生物：
大肠杆菌 - 标签：
抗菌活性
输入
- 输入：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
3 - 输出一致性：
固定 - 解释： 三个二进制输出，分别指示化合物是否满足eNTRy规则的每个标准，即低球状性、低旋转键数量和存在伯胺基团。值为1表示化合物满足相应标准，值为0表示不满足。
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| rb | 整数 | high | 低灵活性（旋转键数量小于或等于5） |
| glob | 整数 | high | 低球状性（小于或等于0.25） |
| primary_amine | 整数 | high | 确定分子是否具有伯胺基团 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos7ike
- Docker架构：
AMD64，ARM64 - S3存储：[***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1 - 环境大小（Mb）：
620 - 镜像大小（Mb）：
765.49
计算性能（秒）：
- 10个输入：
29.13 - 100个输入：
452.73 - ***个输入：
-1
参考文献
- 源代码：https://github.com/HergenrotherLab/entry-cli
- 出版物：[***]
- 出版物类型：
同行评审 - 出版年份：
2017 - Ersilia贡献者： https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型的"按原样"访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82%E5%8F%AF%E9%80%9A%E8%BF%87%E4%BB%A5%E4%B8%8B%E5%91%BD%E4%BB%A4**%E8%8E%B7%E5%8F%96**%E6%A8%A1%E5%9E%8B%EF%BC%9A
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos7ike
然后，可按以下方式服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos7ike # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一个技术非营利组织，旨在推动全球南方的可持续研究。若发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E8%BF%90%E8%A1%8C%E6%97%B6%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82%E8%8B%A5%E5%B8%8C%E6%9C%9B%E4%B8%BA%E6%88%91%E4%BB%AC%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%E5%81%9A%E5%87%BA%E8%B4%A1%E7%8C%AE%EF%BC%8C%E5%8F%AF%E8%80%83%E8%99%91***%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos7ike:<标签>
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