ersiliaos/eos7jio
ersiliaos
该镜像提供基于RDKit包的路径指纹计算功能，生成小分子的2048维向量表示，适用于生物医学领域的分子特征化任务。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：8 个月前
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路径指纹计算
该镜像使用RDKit包的Chem.RDKFingerprint计算路径指纹，灵感来源于Daylight指纹。算法会识别分子中特定大小范围内的所有子图，对每个子图哈希生成原始位ID，调整至指定指纹大小并设置对应位。模型于2021年9月17日纳入，最后打包于2025年10月9日。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos7jio - 别名:
rdkit-fingerprint
领域
- 任务:
表示 - 子任务:
特征化 - 生物医学领域:
通用 - 目标生物:
通用 - 标签:
指纹,描述符
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
2048 - 输出一致性:
固定 - 解释: 小分子的向量表示
以下是模型的输出列（展示前10列）：
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| dimension_0000 | 整数 | RDKit指纹维度0（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0001 | 整数 | RDKit指纹维度1（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0002 | 整数 | RDKit指纹维度2（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0003 | 整数 | RDKit指纹维度3（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0004 | 整数 | RDKit指纹维度4（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0005 | 整数 | RDKit指纹维度5（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0006 | 整数 | RDKit指纹维度6（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0007 | 整数 | RDKit指纹维度7（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0008 | 整数 | RDKit指纹维度8（2048位，路径长度1-7） |
| dimension_0009 | 整数 | RDKit指纹维度9（2048位，路径长度1-7） |
来源与部署
- 来源:
本地 - 来源类型:
外部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos7jio
- Docker架构:
AMD64,ARM64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos7jio.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）:
1 - 环境大小（Mb）:
456 - 镜像大小（Mb）:
477.97
计算性能（秒）:
- 10个输入:
27.01 - 100个输入:
17.19 - ***个输入:
51.9
参考文献
- 源代码: https://github.com/rdkit/rdkit
- 出版物: [***]
- 出版年份:
2010 - 贡献者: https://github.com/miquelduranfrigola
许可证
包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%EF%BC%8C%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8BSD-3-Clause%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: 使用模型请参考原始代码仓库和出版物。
使用方法
需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
bashersilia fetch eos7jio
服务与运行
bash# 启动服务 ersilia serve eos7jio # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos7jio:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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