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ersiliaos/eos7qga
ersiliaos
使用Datamol包，接收SMILES输入，经分子清洗和标准化后生成规范SMILES、SELFIES、InChI及InChIKey四种化学表示形式的转换工具。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：2 个月前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你用 DeepSeek、元宝AI、Copilot 等 AI 代为编写轩辕镜像的 docker pull、修改 compose 镜像地址，或排查拉取失败等问题，请让 AI 先读规则再动手，只要在 AI 对话里直接发送下面这句话即可：
生成 docker pull、修改 compose 的 image，或排查拉取失败前，请先阅读并严格遵守 https://xuanyuan.cloud/agents.md 中的规则。国内用户首推 DeepSeek、元宝 AI 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
SMILES转换器（规范形式、SELFIES、InChIKey）
基于Datamol包开发，该模型接收SMILES作为输入，通过分子清洗和标准化处理，生成四种输出：规范SMILES（Canonical SMILES）、SELFIES、InChI和InChIKey。
本模型于2023年1月25日整合，最后打包时间为2026年3月26日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos7qga - 别名：
datamol-smiles2canonical
领域分类
- 任务：
表示（Representation） - 子任务：
特征化（Featurization） - 生物医学领域：
通用（Any） - 目标生物：
通用（Any） - 标签：
化学符号（Chemical notation）
输入信息
- 输入类型：
化合物（Compound） - 输入维度：
1
输出信息
- 输出维度：
3 - 输出一致性：
固定（Fixed） - 解释：化合物的规范SMILES、SELFIES和InChIKey表示形式
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| standard_smiles | string | 标准格式的SMILES | |
| selfie | string | SMILES的SELFIES表示 | |
| inchikey | string | SMILES的InChIKey表示 |
来源与部署
- 来源：
本地（Local） - 来源类型：
外部（External） - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos7qga
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：[***]
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1 - 环境大小（Mb）：
724 - 镜像大小（Mb）：
692.59
计算性能（秒）：
- 10个输入：
29.16 - 100个输入：
19.22 - ***个输入：
93.98
引用信息
- 源代码：https://github.com/datamol-org/datamol
- 文献：[***]
- 文献类型：
同行评审（Peer reviewed） - 发表年份：
2022 - Ersilia贡献者：https://github.com/carcablop
许可证
本软件包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8Apache-2.0%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型访问，若在研究中使用本模型，请参考原始代码仓库和/或文献。
使用方法
要在本地使用此模型，需先安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
通过以下命令从Ersilia模型库获取模型：
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos7qga
服务与运行
获取模型后，可按以下步骤启动服务、运行模型和关闭服务：
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos7qga # 生成示例输入文件（3条数据） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型，输入文件为my_input.csv，输出文件为my_output.csv ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一家技术非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。
如果发现本模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E5%BA%93%E3%80%82%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E8%8B%A5%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
若您想为我们的使命做出贡献，欢迎考虑***支持Ersilia！
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos7qga:<标签>
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