ersiliaos/eos7yti
ersiliaos
该镜像提供基于Open Source Malaria Series 4数据训练的模型，用于预测小分子体外抗恶性疟原虫的活性（IC50 <1uM和2.5uM的概率），助力抗疟疾药物研发。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：7 个月前
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基于OSM的抗疟疾活性预测模型
该模型用于预测小分子体外抗疟疾的潜力。我们收集了Open Source Malaria Series 4分子的可用数据，并使用1uM和2.5uM两个阈值定义活性。模型通过LazyQSAR包训练，在5折交叉验证中对20%的测试数据表现出AUROC>0.8，已被Ersilia用于生成新的Series 4候选分子。
该模型于2023-08-02整合，最后打包于2025-11-19。
信息
标识符
- Ersilia标识符:
eos7yti - 别名:
osm-series4
领域
- 任务:
注释 - 子任务:
活性预测 - 生物医学领域:
疟疾 - 目标生物:
恶性疟原虫 - 标签:
疟疾,恶性疟原虫,IC50
输入
- 输入类型:
化合物 - 输入维度:
1
输出
- 输出维度:
2 - 输出一致性:
固定 - 解释: 体外杀死恶性疟原虫的概率（分别对应IC50 <1uM和2.5uM）
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| ic50_1um | float | high | 以1uM为阈值，抑制恶性疟原虫的概率（IC50指标） |
| ic50_2point5um | float | high | 以2.5uM为阈值，抑制恶性疟原虫的概率（IC50指标） |
来源与部署
- 来源:
本地 - 来源类型:
内部 - DockerHub: https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos7yti
- Docker架构:
AMD64,ARM64 - S3存储: https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos7yti.zip
资源消耗
- 模型大小 (Mb):
5 - 环境大小 (Mb):
7610 - 镜像大小 (Mb):
7499.4
计算性能（秒）:
- 10个输入:
61.7 - 100个输入:
60.34 - ***个输入:
627.62
参考文献
- 源代码: https://github.com/ersilia-os/lazy-qsar
- 出版物: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmedchemlett.4c00131
- 出版物类型:
同行评审 - 出版年份:
2024 - Ersilia贡献者: https://github.com/GemmaTuron
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8GPL-3.0-or-later%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意: Ersilia直接从原作者处提供模型，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82 可通过以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型 hub 获取模型 ersilia fetch eos7yti
然后，可按以下步骤服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos7yti # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***] 如果发现该模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B hub。若运行时遇到任何问题，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82 若想为我们的使命做贡献，考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos7yti:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"