ersiliaos/eos8451
ersiliaos
该镜像提供基于GROVER transformer模型的有机小分子水溶性预测功能，输出以mol/L为单位的log溶解度，模型训练采用MoleculeNet ESOL数据集，性能优于同类先进方法。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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水溶性预测
该镜像包含用于预测常见有机小分子水溶性数据（以mol/L为单位的log溶解度）的模型，基于MoleculeNet ESOL数据集训练，采用GROVER transformer进行分子特征提取，其预测性能在MoleculeNet基准数据集上优于其他先进方法。
信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos8451 - 别名：
grover-esol
领域
- 任务：
注释 - 子任务：
属性计算或预测 - 生物医学领域：
ADMET（药物吸收、分布、代谢、排泄和毒性） - 目标生物：
任意 - 标签：
溶解度、MoleculeNet、ADME、LogS、化学图模型
输入
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释：log溶解度（mol/L）
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| log_solubility | float | high | 化合物在水中的log溶解度（单位：mol/L） |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos8451
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos8451.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1417 - 环境大小（Mb）：
2405 - 镜像大小（Mb）：
6680.3
计算性能（秒）：
- 10个输入：
35.44 - 100个输入：
162.15 - ***个输入：
-1（未测试）
参考文献
- 源代码：https://github.com/tencent-ailab/grover
- 论文：https://arxiv.org/abs/2007.02835
- 论文类型：
预印本 - 发表年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/Amna-28
许可证
本包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型访问，若在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或论文。
使用方法
要在本地使用该模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
获取模型
bash# 从Ersilia模型库获取模型 ersilia fetch eos8451
服务与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos8451 # 生成包含3个示例的输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型并输出结果 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
若该模型对您的研究有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E5%BA%93%E3%80%82%E8%BF%90%E8%A1%8C%E8%BF%87%E7%A8%8B%E4%B8%AD%E9%81%87%E5%88%B0%E9%97%AE%E9%A2%98%E5%8F%AF%E9%80%9A%E8%BF%87https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E5%8F%8D%E9%A6%88%E3%80%82
欢迎通过https://www.ersilia.io/donate%E6%94%AF%E6%8C%81Ersilia%E7%9A%84%E4%BD%BF%E5%91%BD%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos8451:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"