ersiliaos/eos85a3
ersiliaos
该镜像用于预测辛醇/水分配系数（pH 7.4时的logD），基于Lipophilicity Molecule Net数据集训练，采用GROVER transformer模型，Ersilia标识符为eos85a3。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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辛醇/水分配系数预测模型
镜像概述和主要用途
本镜像提供辛醇/水分配系数（pH 7.4时的logD）的预测功能，模型使用Lipophilicity Molecule Net数据集训练，基于GROVER transformer架构（分子特征化步骤详情可参考eos7w6n或grover-embedding）。模型于2022年7月19日整合，最后打包时间为2026年3月10日。
核心功能和特性
- 精准预测：针对pH 7.4条件下的logD值进行预测，输出结果为单一浮点数值
- 基于GROVER模型：采用先进的GROVER transformer架构进行分子特征提取和预测
- 标准化输出：提供固定维度的输出，确保结果一致性和可解释性
信息详情
标识符
- Ersilia标识符：
eos85a3 - 简称：
grover-lipo
领域分类
- 任务：
注释 - 子任务：
性质计算或预测 - 生物医学领域：
ADMET（吸收、分布、代谢、排泄、毒性） - 目标生物：
任意 - 标签：
MoleculeNet、Lipophilicity、ADME、LogD、化学图模型
输入信息
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出信息
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释：pH 7.4条件下的预测logD值
输出列说明：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| lipo | float | high | 辛醇/水分配系数 |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos85a3
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos85a3.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
1312 - 环境大小（Mb）：
2548 - 镜像大小（Mb）：
6502.3
计算性能（秒）：
- 10个输入：
34.7 - 100个输入：
158.71 - ***个输入：
-1（未提供）
引用信息
- 源代码：https://github.com/tencent-ailab/grover
- 论文：https://arxiv.org/abs/2007.02835
- 论文类型：
预印本 - 发表年份：
2020 - Ersilia贡献者：https://github.com/Amna-28
许可证
本软件包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E5%8C%85%E5%86%85%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia直接从原作者处提供模型访问，使用模型进行研究时请参考原始代码仓库和/或论文。
使用方法和配置说明
前提条件
本地使用需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
基本操作流程
获取模型
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos85a3
服务与运行
bash# 启动模型服务 ersilia serve eos85a3 # 生成示例输入文件（3个样本） ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型预测 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
关于Ersilia
[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos85a3:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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