ersiliaos/eos8c0o
ersiliaos
基于ImageMol的深度学习模型，预训练于1000万未标记小分子并微调，用于预测化合物对人类β-分泌酶1（BACE-1）的抑制作用，基于MoleculeNet的1522个化合物数据集，pIC50≥7的化合物被视为BACE-1抑制剂，Ersilia标识符eos8c0o。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：3 个月前
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ImageMol 人类β-分泌酶1（BACE-1）抑制预测模型
该模型基于ImageMol开发，这是一种在1000万未标记小分子上预训练的深度学习模型，随后通过微调步骤预测抑制剂与人类β-分泌酶1（BACE-1）蛋白的结合。MoleculeNet的BACE-1数据集包含1522种化合物及其相关pIC50值，pIC50≥7的化合物被视为BACE-1抑制剂。
本模型于2023年1月11日纳入，最后打包日期为2026年3月10日。
基本信息
标识符
- Ersilia标识符：
eos8c0o - 简称：
image-mol-bace
领域信息
- 任务：
注释 - 子任务：
活性预测 - 生物医学领域：
阿尔茨海默症 - 目标生物：
智人（Homo sapiens） - 标签：
BACE、化学图模型、MoleculeNet
输入信息
- 输入类型：
化合物 - 输入维度：
1
输出信息
- 输出维度：
1 - 输出一致性：
固定 - 解释：BACE-1抑制概率（>0.5：抑制剂）。pIC50≥7的化合物被视为BACE-1抑制剂
以下是模型的输出列：
| 名称 | 类型 | 方向 | 描述 |
|---|---|---|---|
| bace_inh_prob | float | high | BACE-1抑制概率（阈值pIC50≥7） |
来源与部署
- 来源：
本地 - 来源类型：
外部 - DockerHub：https://hub.docker.com/r/ersiliaos/eos8c0o
- Docker架构：
AMD64 - S3存储：https://ersilia-models-zipped.s3.eu-central-1.amazonaws.com/eos8c0o.zip
资源消耗
- 模型大小（Mb）：
44 - 环境大小（Mb）：
8386 - 镜像大小（Mb）：
8476.78
计算性能（秒）：
- 10个输入：
29.78 - 100个输入：
23.15 - ***个输入：
311.13
参考资料
- 源代码：https://github.com/ChengF-Lab/ImageMol
- 出版物：https://www.nature.com/articles/s42256-022-00557-6
- 出版物类型：
同行评审 - 出版年份：
2022 - Ersilia贡献者：https://github.com/DhanshreeA
许可证
本软件包采用https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/LICENSE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82%E8%BD%AF%E4%BB%B6%E5%8C%85%E4%B8%AD%E5%8C%85%E5%90%AB%E7%9A%84%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E9%87%87%E7%94%A8MIT%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E8%AF%81%E3%80%82
注意：Ersilia按原样提供模型访问，直接来自原始作者。如果在研究中使用该模型，请参考原始代码仓库和/或出版物。
使用方法
要在本地使用此模型，需安装https://github.com/ersilia-os/ersilia%E3%80%82
可通过以下命令获取模型：
bash# 从Ersilia模型中心获取模型 ersilia fetch eos8c0o
然后，可按以下步骤服务、运行和关闭模型：
bash# 服务模型 ersilia serve eos8c0o # 生成示例文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型 ersilia close
关于Ersilia
[***]
如果发现此模型有用，请https://github.com/ersilia-os/ersilia/blob/master/CITATION.cffErsilia%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E4%B8%AD%E5%BF%83%E3%80%82%E5%A6%82%E6%9E%9C%E5%9C%A8%E8%BF%90%E8%A1%8C%E6%A8%A1%E5%9E%8B%E6%97%B6%E9%81%87%E5%88%B0%E4%BB%BB%E4%BD%95%E9%97%AE%E9%A2%98%EF%BC%8C%E8%AF%B7%E9%9A%8F%E6%97%B6https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E3%80%82
如果您想为我们的使命做出贡献，欢迎考虑https://www.ersilia.io/donate%E7%BB%99Ersilia%EF%BC%81
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos8c0o:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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运维工程师
Linux服务器
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