ersiliaos/eos9yui
ersiliaos
该镜像提供天然产物相似性评分模型，基于天然产物指纹衍生，可预测分子的天然产物相似性，性能优于RDKit中的NP_Score，适用于生物医学领域化合物属性研究。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：ersiliaos仓库类型：镜像最近更新：9 个月前
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天然产物相似性评分模型
镜像概述
本模型衍生自天然产物指纹（eos6tg8），除生成特定天然产物指纹外，预测分子是否为天然产物的神经元激活值可作为天然产物相似性（NP-likeness）评分。该方法性能优于RDKit中实现的NP_Score，模型于2021年10月22日纳入，最后打包时间为2025年9月15日。
核心功能
- 计算分子的天然产物相似性评分，输出维度固定为1
- 评分越高表示分子的天然产物相似性越强
- 支持批量处理，10/100/***个输入的计算时间分别为29.03/19.16/145.26秒
使用场景
适用于生物医学领域的化合物属性预测任务，帮助研究人员评估分子的天然产物特性，辅助药物发现、天然产物筛选等相关研究工作。
配置说明
基本标识符
- Ersilia标识符：
eos9yui - Slug：
natural-product-likeness
领域分类
- 任务：注释
- 子任务：属性计算或预测
- 生物医学领域：通用
- 目标生物：通用
- 标签：天然产物、类药性
输入输出
- 输入：化合物（维度1）
- 输出：天然产物相似性评分（维度固定为1）
- 输出列详情： | 名称 | 类型 | 方向 | 描述 | |------|------|------|------| | np_score | float | high | 天然产物相似性评分 |
资源消耗
- 模型大小：63 Mb
- 环境大小：1548 Mb
- 镜像大小：1622.5 Mb
部署与使用步骤
需先安装Ersilia CLI工具（https://github.com/ersilia-os/ersilia%EF%BC%89%EF%BC%8C%E5%86%8D%E6%89%A7%E8%A1%8C%E4%BB%A5%E4%B8%8B%E5%91%BD%E4%BB%A4%EF%BC%9A
bash# 从Ersilia模型Hub获取模型 ersilia fetch eos9yui # 启动模型服务 ersilia serve eos9yui # 生成3个样本的示例输入文件 ersilia example -n 3 -f my_input.csv # 运行模型并输出结果 ersilia run -i my_input.csv -o my_output.csv # 关闭模型服务 ersilia close
参考信息
- 源代码：https://github.com/kochgroup/neural_npfp
- 学术出版物：[***]
- 许可证：包采用GPL-3.0许可证，模型无特定许可证
关于Ersilia
Ersilia开源计划是一家技术非营利组织，致力于推动全球南方的可持续研究。若使用本模型，请引用Ersilia Model Hub；遇到问题可通过https://github.com/ersilia-os/ersilia/issues%E5%8F%8D%E9%A6%88%EF%BC%9B%E5%A6%82%E9%9C%80%E6%94%AF%E6%8C%81%E5%85%B6%E4%BD%BF%E5%91%BD%EF%BC%8C%E5%8F%AF%E8%80%83%E8%99%91***%E3%80%82
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull ersiliaos/eos9yui:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
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