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Weather Research and Forecasting Model (WRF) 是用于大气建模和业务预报的数值天气预报模型,intel/intel-optimized-wrf:latest Docker镜像简化了其复杂依赖管理,推荐在第4代Intel® Xeon®可扩展处理器上使用。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:intel仓库类型:镜像最近更新:2 年前
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WRF Docker镜像文档

镜像概述和主要用途

Weather Research and Forecasting Model (WRF) 是一款用于大气建模和业务预报的数值天气预报模型。由于其构建过程涉及一系列依赖项,通常较为复杂。本Docker镜像intel/intel-optimized-wrf:latest旨在简化WRF的部署和运行流程,推荐在第4代Intel® Xeon®可扩展处理器上使用以获得最佳性能。

核心功能和特性

  • 简化依赖管理:封装WRF运行所需的所有依赖项,避免复杂的本地环境配置
  • Intel优化:针对Intel处理器进行性能优化,提升计算效率
  • 灵活资源配置:支持根据硬件条件调整CPU核心使用数量
  • 标准化部署:提供一致的运行环境,确保结果可复现

使用场景和适用范围

  • 气象研究机构进行数值天气预报模型开发与测试
  • 学术机构开展大气科学相关研究
  • 业务天气预报系统的快速部署和验证
  • 高性能计算环境下的WRF性能测试与优化

使用方法和配置说明

1. 检查硬件配置

运行镜像前需确定主机物理CPU数量,可通过以下命令查看:

bash
lscpu

2. 运行Docker镜像

根据CPU数量指定容器可使用的CPU核心范围,基本命令格式如下:

bash
docker run --cpuset-cpus <num>-<num> -it --name wrf-hpckit -v <path_to_run_file>/run.sh:/home/run.sh -v <local_directory_to_get_logfiles>:/log wrf-hpckit:latest

参数说明:

  • --cpuset-cpus <num>-<num>:限制容器使用的CPU核心范围,如0-3表示使用第1至第4个CPU核心(从0开始编号),或1,3表示使用第2和第4个CPU核心
  • -v <path_to_run_file>/run.sh:/home/run.sh:挂载本地run.sh脚本到容器内
  • -v <local_directory_to_get_logfiles>:/log:挂载本地目录用于存储WRF生成的日志文件

3. 创建run.sh脚本

需创建run.sh脚本以下载WRF基准测试数据并配置运行参数。以下示例基于8 CPU的第4代Intel® Xeon®可扩展处理器:

bash
#!/bin/bash

# 下载CONUS-12km基准测试数据
wget -c https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/users/benchmark/v44/v4.4_bench_conus12km.tar.gz
tar -zxf v4.4_bench_conus12km.tar.gz

# 链接测试文件到WRF运行目录
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/* /WRF/run
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/wrfbdy_d* /WRF/run
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/wrfinput_d* /WRF/run
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/*.dat /WRF/run
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/namelist.input.restart /WRF/run/namelist.input
ln -sf /v4.4_bench_conus12km/wrfrst_d01_2019-11-26_23:00:00.ifort /WRF/run/wrfrst_d01_2019-11-26_23:00:00

# 配置并行计算参数
export PROCESS_PER_NODE=4
export OMP_NUM_THREADS=2
export I_MPI_PIN_DOMAIN=auto
export I_MPI_PIN_ORDER=bunch
export OMP_PROC_BIND=close
export OMP_PLACES=threads
export KMP_BLOCKTIME=10
export KMP_STACKSIZE=128M
export WRF_NUM_TILES=48

# 设置系统资源限制
ulimit -S -s unlimited
ulimit -S -m unlimited
ulimit -S -d unlimited

# 运行WRF
cd /WRF/run
mpiexec.hydra -genvall -n $PROCESS_PER_NODE -ppn $PROCESS_PER_NODE ./wrf.exe

注意:可通过修改下载链接更换基准测试数据集,其他WRF测试案例可参考:https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/users/benchmark/v44/benchdata_v44.html

4. 关键变量配置说明

run.sh脚本中的环境变量需根据硬件配置调整,核心原则:PROCESS_PER_NODE * OMP_NUM_THREADS 应等于物理CPU数量。主要变量说明:

变量说明
PROCESS_PER_NODE每节点MPI进程数,应与硬件核心数对应
OMP_NUM_THREADS每个进程的OpenMP线程数,设置并行区域的初始线程数
I_MPI_PIN_DOMAIN控制进程线程在节点内的绑定范围
I_MPI_PIN_ORDER定义MPI进程到域的映射顺序
OMP_PROC_BIND控制线程亲和性策略,决定线程是否可在不同位置间移动
OMP_PLACES指定OpenMP程序执行时可用的位置列表
KMP_BLOCKTIME线程完成并行区域后等待睡眠的时间(毫秒)
KMP_STACKSIZE为每个并行线程分配的私有栈大小(支持b/k/m/g/t为单位)
WRF_NUM_TILES网格分块数量,最优值取决于模型特性和硬件

参考资料

  • https://www.intel.com/content/www/us/en/docs/mpi-library/developer-reference-linux/2021-8/interoperability-with-openmp-api.html
  • https://www.ibm.com/docs/en/xl-c-aix/13.1.2?topic=openmp-omp-num-threads
  • https://www.intel.com/content/www/us/en/docs/mpi-library/developer-reference-linux/2021-8/interoperability-with-openmp-api.html
  • https://www.intel.com/content/www/us/en/docs/mpi-library/developer-reference-linux/2021-8/interoperability-with-openmp-api.html#GUID-525A9B9B-E2D8-4182-AA9F-AEBCE6D31B63
  • https://www.ibm.com/docs/en/xl-c-aix/13.1.2?topic=openmp-omp-proc-bind
  • https://www.ibm.com/docs/en/xl-fortran-linux/16.1.0?topic=openmp-omp-places
  • http://astroa.physics.metu.edu.tr/MANUALS/intel_ifc/mergedProjects/optaps_for/common/optaps_par_var.htm
  • http://astroa.physics.metu.edu.tr/MANUALS/intel_ifc/mergedProjects/optaps_for/common/optaps_par_var.htm
  • WRF_NUM_TILES

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 intel-optimized-wrf 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/intel/intel-optimized-wrf:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull intel/intel-optimized-wrf:<标签>

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