stefancrain/folding-at-home Docker 镜像 - 轩辕镜像 | Docker 镜像高效稳定拉取服务

在Docker中运行Folding@Home（支持GPU）

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对抗COVID-19及其他疾病

简要说明：Folding@Home通过模拟COVID-19蛋白质动态，寻找新的治疗机会。本容器分发相关程序，希望增加安装量以助力科研。

FAH相关链接

• [[FAQ] SARS-CoV-2 (COVID-19)项目与FAH]([***]
• 冠状病毒：我们正在做什么以及您如何提供帮助（简明版）
• 科学家努力提供更多工作单元的实时画面

非官方，不提供官方支持

我并非F@H团队成员。我会积极处理此处的问题，并已设置自动更新机制以应对我不在时的更新。此镜像发布于stefancrain/folding-at-home，会随着Folding@Home团队发布更新而自动更新。源代码托管在GitHub：stefancrain/folding-at-home

支持的架构

• CPU：amd64
• GPU：Nvidia 和 AMD
  • F@H支持的GPU列表
  • NVIDIA/nvidia-docker - 我的无头Ubuntu 18.04设置的gist
  • 待办：添加AMD的gist

部署方法

CLI docker run

bash
docker run \
  --gpus all \
  -p 7396:7396 \
  stefancrain/folding-at-home:latest \
  --user=您的名称 \
  --team=229500 \
  --power=full \
  --gpu-usage=100 \
  --cpu-usage=100

Docker Compose

Docker Compose的GPU访问目前受compose上游问题#6691阻碍，相关跟踪见#4。这仅支持CPU折叠：

bash
---
version: "3"
services:
  folding-at-home:
    image: stefancrain/folding-at-home:latest
    container_name: folding-at-home
    ports:
      - 7396:7396
    restart: unless-stopped
    command: ["--user=您的名称","--team=229500","--power=full","--gpu=false","--cpu-usage=100"]

Kubernetes (K8s)

我家里目前没有K8s集群，因此包含用户在其配置中运行此镜像的示例。

• onedr0p/k3s-gitops 运行良好，但/u/onedrop没有经过批准的GPU进行测试
• coreweave/fah-docker（另一个不同的容器）但支持GPU启用的docker容器的配置，未测试（由我）

待办：创建K8s集群并测试！

故障排除和常见问题（FAQ）

Nvidia

Docker能否识别所有GPU？

bash
docker run \
 --rm \
 --gpus all \
 --entrypoint="nvidia-smi" \
 stefancrain/folding-at-home:latest

FAHClient

此容器的FAHClient默认设置是什么？

• 用户：Anonymous
• 团队：Homelab - 229500
• 电源模式：full（使用全部CPU）
• GPU使用率：100%
• CPU使用率：100%
• web-allow/allow：允许端口7396的网络流量
• smp：支持对称多处理

如何查看FAHClient配置？

bash
docker run \
 --rm \
 --gpus all \
 --entrypoint="/usr/bin/FAHClient" \
 stefancrain/folding-at-home:latest \
 --info

如何查看其他配置选项？

bash
docker run \
 --rm \
 --entrypoint="/usr/bin/FAHClient" \
 stefancrain/folding-at-home:latest \
 --help

如何查看进度？

默认情况下，容器在本地网络的127.0.0.1:7396开放访问，可通过该地址查看进度。