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mskcc/roslin-variant-samtools
mskcc
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5万+ 次下载1 年前更新
staphb/samtools
staphb
基于htslib库的C语言工具，用于处理下一代测序数据
5 次收藏100万+ 次下载2 个月前更新
google/deepvariant
google
Google开发的Docker镜像google/deepvariant，集成基于深度学习的基因组变异检测工具DeepVariant，可从全基因组（WGS）、全外显子（WES）等测序数据中精准识别单核苷酸变异（SNVs）与插入缺失（indels），无需手动配置复杂环境，简化部署流程，凭借深度学习模型提升变异检测准确性，广泛适用于科研机构及临床基因组分析场景。
22 次收藏100万+ 次下载2 个月前更新
mgibio/samtools-cwl
mgibio
包含samtools、htslib和tabix的Docker镜像，用于CWL工作流，为解决版本兼容性问题明确安装htslib 1.3.2，镜像版本从v1.0.0开始。
6 次收藏100万+ 次下载3 年前更新
mgibio/samtools
mgibio
用于处理高通量测序数据中SAM、BAM等格式文件的工具集Docker镜像，基于HTSlib，提供格式转换、排序、索引及统计等功能。
2 次收藏50万+ 次下载7 个月前更新
biocontainers/samtools
biocontainers
BioContainers是社区驱动的生物信息学容器项目，基于Docker和rkt技术，提供标准化的生物信息学软件容器，支持本地、云环境及HPC集群部署，确保软件运行环境一致性和分析可重复性，适用于基因组学、蛋白质组学等组学领域。
13 次收藏50万+ 次下载6 年前更新
imamiland/variant-forge
imamiland
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1万+ 次下载20 天前更新
biocontainers/samtools-test
biocontainers
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7.5千+ 次下载6 年前更新
nanozoo/samtools
nanozoo
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5.1千+ 次下载2 年前更新
mskcc/roslin-variant-gatk
mskcc
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10万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-picard
mskcc
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10万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-cmo-utils
mskcc
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10万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-delly
mskcc
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10万+ 次下载6 年前更新
ikmb/deepvariant
ikmb
基于DeepVariant的Nextflow管道，用于端到端变异检测，从原始fastQ文件生成多样本VCF，预配置适用于CCGA MedCluster。
359 次下载2 年前更新
mskcc/roslin-variant-roslin-qc
mskcc
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1万+ 次下载1 年前更新
mskcc/roslin-variant-htslib
mskcc
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5万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-abra
mskcc
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1万+ 次下载6 年前更新
nanozoo/bed_samtools
nanozoo
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41 次下载2 年前更新
mskcc/roslin-variant-conpair
mskcc
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1万+ 次下载4 年前更新
mskcc/roslin-variant-vardict
mskcc
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5万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-mutect
mskcc
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1万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-vcf2maf
mskcc
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1万+ 次下载6 年前更新
mskcc/roslin-variant-remove-variants
mskcc
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1万+ 次下载6 年前更新
biocontainers/bioconductor-rsamtools
biocontainers
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574 次下载8 年前更新
mskcc/roslin-variant-ngs-filters
mskcc
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1万+ 次下载6 年前更新
johnkilonzi/samtools
johnkilonzi
A docker image for Samtools
1万+ 次下载3 年前更新
swglh/samtools
swglh
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1万+ 次下载6 个月前更新
gsaksena/samtools_filter
gsaksena
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5万+ 次下载9 年前更新
rtibiocloud/convert_variant_ids
rtibiocloud
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1万+ 次下载1 年前更新
blcdsdockerregistry/samtools
blcdsdockerregistry
Docker化的SAMtools工具，用于读取、写入、编辑、索引和查看SAM/BAM/CRAM格式的生物信息学序列比对数据，方便在容器环境中进行高效的基因组数据处理。
1万+ 次下载4 年前更新
abralab/samtools
abralab
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1万+ 次下载4 年前更新
webvariants/php
webvariants
提供PHP 5.6及7.0-7.4版本的运行环境，包含常用扩展及灵活配置选项，支持自定义环境变量、性能分析（xhgui）与定时任务，适用于PHP应用的开发、测试与部署。
1 次收藏1万+ 次下载6 年前更新
mblanche/bwa-samtools
mblanche
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1万+ 次下载4 年前更新
dceoy/samtools
dceoy
samtools Docker镜像是用于处理SAM/BAM格式测序数据的工具集，支持序列比对、格式转换、索引构建及变异检测等生物信息学核心分析任务。
1万+ 次下载2 年前更新
dyeramosu/samtools
dyeramosu
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dmiller15/samtools
dmiller15
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1万+ 次下载4 年前更新
jbalberge/samtools_cloud
jbalberge
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ctomlins/samtools
ctomlins
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mxhe/star_samtools
mxhe
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buddej/varianteval
buddej
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mjblow/samtools-1.9
mjblow
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swglh/bwa-samtools
swglh
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fernandamrod/vep_samtools
fernandamrod
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jbwebster/samtools_docker
jbwebster
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1万+ 次下载5 年前更新
vanallenlab/common_variant_filter
vanallenlab
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1万+ 次下载5 年前更新
getwilds/samtools
getwilds
用于处理高通量测序数据的Samtools工具套件Docker镜像，支持SAM/BAM格式文件操作（如转换、排序、索引等），包含Bedtools工具，适用于基因组数据分析场景。
1万+ 次下载7 个月前更新
swglh/samtools_picard
swglh
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xbrianh/xsamtools
xbrianh
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kishwars/pepper_deepvariant
kishwars
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4 次收藏10万+ 次下载4 年前更新
cwozaki/variantdev-mod
cwozaki
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kylera/samtools-suite
kylera
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philipssoftware/variant
philipssoftware
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vanallenlab/samtools_bcftools_htslib
vanallenlab
该镜像集成samtools、bcftools和htslib三大生物信息学工具，基于Ubuntu系统构建，用于基因组测序数据的比对、变异检测及格式转换等核心任务。
10万+ 次下载5 年前更新
cmopipeline/fastp-bwa-samtools
cmopipeline
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1万+ 次下载6 年前更新
bmennis/samtools_gsnap
bmennis
a container to run samtools and gsnap
1万+ 次下载7 年前更新
variantconst/openwebui-monitor
variantconst
通过高效的OpenWebUI仪表板优化用户跟踪和配额管理。
1万+ 次下载4 个月前更新
neonvariant/transmute
neonvariant
Transmute是一款免费开源的自托管文件转换工具，专注于隐私保护和自动化，支持本地转换图像、视频、音频、文档等多种格式，无文件大小限制，无需第三方访问文件。
3 次收藏1万+ 次下载17 小时前更新
dajunluo/deepvariant
dajunluo
本地运行Google的DeepVariant，无需Google Cloud Platform，已包含适用于全基因组测序(WGS)数据的Inception-V3标准模型，当前版本r0.8.0，暂不支持GPU。
7 次收藏5万+ 次下载7 年前更新
rahulg603/gatk_samtools_docker
rahulg603
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1万+ 次下载3 年前更新
ekofman/samtools_libcurl
ekofman
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1万+ 次下载7 年前更新
pegi3s/samtools_bcftools
pegi3s
用于运行SAMtools-BCFtools套件的Docker镜像，该套件提供处理高通量测序数据的工具集，支持SAM/BAM文件处理、变异检测、统计分析等生物信息学研究任务。
2 次收藏1万+ 次下载12 个月前更新
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