immcantation/suite
immcantation
Immcantation套件镜像，支持应用程序和数据库，需拉取特定标签，无“latest”标签。
6 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：immcantation仓库类型：镜像最近更新：11 天前
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如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Immcantation Docker 镜像文档
!Docker Pulls](https://hub.docker.com/u/immcantation) !AIRR-C 标准兼容]([***] !贡献者公约](https://github.com/immcantation/immcantation/?tab=readme-ov-file#coc-ov-file)
镜像概述和主要用途
Immcantation 是一个用于高通量适应性免疫受体库测序（AIRR-seq）数据集的完整分析生态系统。尽管主要专注于 B 细胞受体（BCR）分析，但方法同样适用于 T 细胞受体（TCR）。该框架提供从原始读取数据开始的预处理、群体结构确定和受体库分析功能，包含 Python 和 R 软件包。
Docker 镜像提供了 Immcantation 框架、其依赖项、辅助脚本和 IgBLAST 的完整安装，还包含 IgBLAST 和 IMGT 参考种系集以及多个示例管道脚本。
核心功能和特性
- 完整的 Immcantation 框架安装
- 包含所有依赖项、辅助脚本和 IgBLAST 工具
- 内置 IgBLAST 和 IMGT 参考种系数据库
- 提供多个示例管道脚本
- 符合 AIRR-C sw-tools v1 标准
- 支持 BCR 和 TCR 受体库分析
使用场景和适用范围
- 高通量 AIRR-seq 数据分析
- B 细胞受体（BCR）深度分析
- T 细胞受体（TCR）序列分析
- 适应性免疫受体库研究
- 免疫学和相关领域的生物信息学研究
镜像获取与版本控制
镜像地址
Docker Hub: https://hub.docker.com/r/immcantation/suite
版本标签说明
- 官方发布版本: 使用元版本号标签（如
1.0.0） - 开发版本:
devel标签表示最新开发（不稳定）构建 - 注意: 不提供
latest标签，必须指定具体版本标签
获取镜像
bashdocker pull immcantation/suite:<tag>
例如，拉取 1.0.0 版本:
bashdocker pull immcantation/suite:1.0.0
使用方法
基本运行命令
bashdocker run -it --rm immcantation/suite:<tag>
挂载数据卷运行
bashdocker run -it --rm -v /本地数据目录:/data immcantation/suite:<tag>
运行示例管道脚本
bashdocker run -it --rm -v /本地数据目录:/data immcantation/suite:<tag> /opt/immcantation/pipelines/example_pipeline.sh
仓库结构
| 文件夹 | 内容描述 |
|---|---|
| docker | Dockerfiles，用于构建Docker Hub上的镜像 |
| docs | Sphinx构建文件，用于ReadTheDocs上托管的文档 |
| pipelines | Docker镜像的示例管道脚本 |
| protocols | 已发表实验方案的引物序列和扩增子设计 |
| scripts | IMGT、IgBLAST和VDJTools的辅助脚本 |
配置Git仓库（开发者用）
如果需要更新Git配置设置：
bashgit config user.email "your-gh-user@email.com" git config user.name "your-gh-user-name" git remote set-url origin git@github.com:immcantation/immcantation.git
文档资源
完整的使用文档、API文档和多个教程可在以下位置找到：
- Immcantation文档门户
注意事项
- 仓库已迁移至新地址: https://github.com/immcantation/immcantation
- 必须指定具体版本标签拉取镜像，不支持
latest标签 - 开发版本(
devel)可能包含未稳定的功能，生产环境建议使用官方发布版本
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull immcantation/suite:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"