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universc

nfcore/universc

nfcore

UniverSC容器的镜像,提供灵活的跨平台单细胞数据处理管道。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:nfcore仓库类型:镜像最近更新:3 年前
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如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具,协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题,请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。

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https://xuanyuan.cloud/agents.md

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UniverSC 容器镜像文档

镜像概述

本镜像为UniverSC的容器镜像,UniverSC是一个灵活的跨平台单细胞(SC)数据处理管道,旨在提供便捷、高效的单细胞数据处理解决方案。该镜像封装了UniverSC的核心功能,可直接用于跨平台环境下的单细胞数据分析任务。

核心功能与特性

  • 跨平台支持:兼容主流操作系统环境,可在不同平台上稳定运行
  • 灵活性:支持多种单细胞数据处理流程配置,适应不同分析需求
  • 集成化:内置单细胞数据处理所需的核心工具与依赖,开箱即用
  • 可扩展性:支持自定义数据处理步骤,满足个性化分析场景

使用场景与适用范围

  • 单细胞测序数据分析与处理
  • 生物信息学研究中的单细胞数据流程构建
  • 跨平台环境下的单细胞数据标准化处理
  • 需要快速部署单细胞分析流程的科研场景

使用方法与配置说明

基本使用(Docker Run)

bash
# 拉取镜像
docker pull docker.xuanyuan.run/[镜像仓库地址]/universc-mirror:latest

# 运行容器(基础示例)
docker run -it --rm -v /本地数据目录:/data docker.xuanyuan.run/universc-mirror

数据挂载说明

为实现数据持久化与文件交互,建议通过-v参数挂载本地数据目录:

bash
# 挂载数据目录并运行
docker run -it --rm -v /path/to/local/data:/data docker.xuanyuan.run/universc-mirror [处理命令]

自定义配置

可通过环境变量或命令行参数调整处理流程(具体参数需参考UniverSC官方文档):

bash
# 通过环境变量配置
docker run -it --rm -e CONFIG_PARAM=value -v /data:/data docker.xuanyuan.run/universc-mirror

# 通过命令行参数配置
docker run -it --rm -v /data:/data docker.xuanyuan.run/universc-mirror --param1 value1 --param2 value2

注:详细配置参数及使用方法请参考UniverSC官方文档,本镜像仅提供容器化运行环境。

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 universc 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/nfcore/universc:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull nfcore/universc:<标签>

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DNS 解析 · 网络超时

TLS 证书失败

no matching manifest(架构)

账号

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manifest · blob · 计费

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企业 · 个人 · 工单

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工单 · 数据 · 注销

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mirrors 不生效

daemon.json · 重启

去掉域名前缀

docker tag · 重命名

指定架构拉取

ARM64 · AMD64 · 多架构

latest 与「最新」

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