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StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟的Docker镜像构建仓库，包含多种程序的Dockerfile，提供集中管理的Docker镜像，方便用户访问，并包含清晰的构建和使用文档。
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本仓库包含构建多种程序Docker镜像所需的Dockerfile和其他相关文件，供StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟成员使用。本仓库的目的是提供一个集中的Docker镜像位置，方便用户访问，并提供关于容器构建方式和使用方法的清晰文档。
作者
每个Dockerfile都列出了特定Docker镜像的作者/维护者，但Docker镜像的作者/维护者如下：
- @kapsakcj
- @nwflorek
- @garfinjm
贡献方式
如果您想贡献自己的Docker镜像或改进现有镜像，请fork本仓库，进行修改/添加，然后提交拉取请求（pull request）。如果您在使用现有镜像时遇到问题，请提交issue。我们欢迎所有反馈！
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Docker用户指南
我们还创建了一份用户指南，概述了使用和开发Docker容器的方法和最佳实践。
Docker用户指南
可用Docker镜像
您也可以在Docker Hub上查看镜像列表：[***]
| 软件 | 版本 | 链接 |
|---|---|---|
| SRA-toolkit   | [] [] |
| Kraken  1.3.1 (Racon) 2.13 (minimap2) | [] [] [***] |
| Roary ![docker pulls]([***] | 3.12.0 | [***] |
| CDC-SPN ![docker pulls]([***] | 0.1（无版本） | [***] |
| Shovill ![docker pulls]([***] | 1.0.4 | [***] |
| BWA ![docker pulls]([***] | 0.7.17 | [***] |
| Samtools ![docker pulls]([***] | 1.9 | [***] |
| cfsan-snp-pipeline ![docker pulls]([***] | 2.0.2 | [***] |
常见问题
轩辕镜像免费版与专业版有什么区别？
免费版仅支持 Docker Hub 加速，不承诺可用性和速度；专业版支持更多镜像源，保证可用性和稳定速度，提供优先客服响应。
轩辕镜像免费版与专业版有分别支持哪些镜像？
免费版仅支持 docker.io；专业版支持 docker.io、gcr.io、ghcr.io、registry.k8s.io、nvcr.io、quay.io、mcr.microsoft.com、docker.elastic.co 等。
流量耗尽错误提示
当返回 402 Payment Required 错误时，表示流量已耗尽，需要充值流量包以恢复服务。
410 错误问题
通常由 Docker 版本过低导致，需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。
manifest unknown 错误
先检查 Docker 版本，版本过低则升级；版本正常则验证镜像信息是否正确。
镜像拉取成功后，如何去掉轩辕镜像域名前缀？
使用 docker tag 命令为镜像打上新标签，去掉域名前缀，使镜像名称更简洁。
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