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staphb/trimmomatic
staphb
Trimmomatic：一款用于Illumina NGS数据的灵活读段修剪工具
2 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：staphb仓库类型：镜像最近更新：9 个月前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
docker-builds
此仓库包含构建StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟成员使用的各种程序的Docker镜像所需的Dockerfile和其他相关文件。该仓库旨在提供集中化的Docker镜像资源，方便用户访问，并附带清晰的容器构建与使用文档。
每个Dockerfile均列出了对应镜像的作者/维护者，主要维护者包括：
- https://github.com/kapsakcj
- https://github.com/k-florek
- https://github.com/garfinjm
- https://github.com/kevinlibuit
- https://github.com/Ikkik
- https://github.com/lskatz
- https://github.com/stjacqrm
如需贡献新镜像或改进现有镜像，请复刻仓库、完成修改后提交拉取请求；如遇镜像问题，请提交issue反馈。欢迎所有建议！ https://staph-b.github.io/docker-builds/contribute/
Docker用户指南
我们提供了包含Docker容器使用与开发方法及最佳实践的用户指南。 https://staph-b.github.io/docker-builds/
可用Docker镜像
staphb/pangolin
staphb
StaPH-B联盟的Docker镜像集中存储库，包含多种公共卫生生物信息学工具的Dockerfile及相关文件，提供清晰的构建和使用文档，支持Docker与Singularity，便于用户访问和使用，助力病原体基因组监测等公共卫生工作。
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3 个月前更新
staphb/samtools
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基于htslib库的C语言工具，用于处理下一代测序数据
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2 个月前更新
staphb/bcftools
staphb
用于变异检测及变异调用格式（VCF）与其二进制对应格式BCF文件处理的Docker镜像
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2 个月前更新
staphb/ivar
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为StaPH-B联盟成员提供多种生物信息学工具的Docker镜像集合，集中管理便于访问，包含清晰的构建与使用文档，且支持Singularity兼容。
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10 个月前更新
staphb/vadr
staphb
StaPH-B联盟的Docker镜像仓库，提供多种生物信息学工具镜像，支持公共卫生实验室病原体基因组分析，托管于Dockerhub和Quay.io，已通过Docker开源计划解除拉取限制。
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1 个月前更新
staphb/fastqc
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FastQC：用于高通量测序数据的质量控制分析工具，可生成详细的质量评估报告，帮助研究人员评估测序数据质量。
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3 年前更新
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"