staphb/unicycler Docker 镜像 - 轩辕镜像 | Docker 镜像高效稳定拉取服务
staphb/unicyclerstaphb
StaPH-B联盟的Docker镜像仓库，包含多种生物信息学工具的Dockerfile及相关文件，提供集中化、易于访问的镜像资源和详细的容器构建与使用文档。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：staphb仓库类型：镜像最近更新：1 年前
docker-builds
本仓库包含StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟成员使用的多种程序的Docker镜像构建所需的Dockerfile和其他各类文件。该仓库旨在提供一个集中化的Docker镜像位置，方便用户访问，并提供关于容器构建方式和使用方法的清晰文档。
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Docker用户指南
我们还创建了一份用户指南，概述了使用和开发Docker容器的方法和最佳实践。
Docker用户指南
关于Singularity？
对于许多人来说，Docker可能不是可选方案，但Singularity是。大多数Docker容器与Singularity兼容，并且可以轻松转换为Singularity格式。请参阅上面链接的用户指南，了解如何从Docker Hub下载Docker镜像以及如何使用Singularity运行它们。我们已努力确保我们的容器与Singularity兼容，但如果您发现不兼容的容器，请提交issue告知我们！
可用Docker镜像
, 0.9.8, 1.0.0 | [***] |
| ARIBA  1.4.3 (Racon) 2.17 (minimap2); 1.9 (Canu) 1.4.3 (Racon) 2.17 (minimap2); 1.9i (Canu) 1.4.3 (Racon) 2.17 (minimap2) (+racon_preprocess.py); 1.7.1 (Canu) 1.3.1 (Racon) 2.13 (minimap2) | [] [] [***] |
| centroid  | [***] |
| cfsan-snp-pipeline  | [***] |
| FastANI , 1.2.1, 1.2.1 (+ SC2 参考序列), 1.2.2 (+SC2 参考序列和artic bedfiles) | [***] |
| kma , 2.0.8-beta_hv (人类+病毒数据库) | [***] |
| kSNP3   | [] [] |
| MAFFT 
staphb/pangolin
staphb
StaPH-B联盟的Docker镜像集中存储库，包含多种公共卫生生物信息学工具的Dockerfile及相关文件，提供清晰的构建和使用文档，支持Docker与Singularity，便于用户访问和使用，助力病原体基因组监测等公共卫生工作。
3 次收藏100万+ 次下载
27 天前更新
staphb/samtools
staphb
基于htslib库的C语言工具，用于处理下一代测序数据
5 次收藏100万+ 次下载
3 个月前更新
staphb/ivar
staphb
为StaPH-B联盟成员提供多种生物信息学工具的Docker镜像集合，集中管理便于访问，包含清晰的构建与使用文档，且支持Singularity兼容。
100万+ 次下载
7 个月前更新
staphb/bcftools
staphb
用于变异检测及变异调用格式（VCF）与其二进制对应格式BCF文件处理的Docker镜像
20 次收藏100万+ 次下载
3 个月前更新
staphb/vadr
staphb
StaPH-B联盟的Docker镜像仓库，提供多种生物信息学工具镜像，支持公共卫生实验室病原体基因组分析，托管于Dockerhub和Quay.io，已通过Docker开源计划解除拉取限制。
2 次收藏100万+ 次下载
1 个月前更新
staphb/kraken2
staphb
Kraken2：分类学序列分类器，部分镜像包含数据库，部分不含数据库。
5 次收藏50万+ 次下载
3 个月前更新
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docker pull 提示 manifest unknown 怎么办？
manifest unknown
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no matching manifest（架构）
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invalid tar header（解压）
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TLS 证书失败
Docker pull 时 DNS 解析超时或连不上仓库怎么办？
DNS 超时
Docker 拉取出现 410 Gone 怎么办？
410 Gone 排查
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402 与流量用尽
Docker 拉取提示 UNAUTHORIZED（401）怎么办？
401 认证失败
遇到 429 Too Many Requests（请求太频繁）怎么办？
429 限流
docker login 提示 Cannot autolaunch D-Bus，还算登录成功吗？
D-Bus 凭证提示
为什么会出现「单层超过 20GB」或 413，无法加速拉取？
413 与超大单层
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用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"