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wwwzhouhui569/aitop100-nano-banana
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nanozoo/nanoplot
nanozoo
NanoPlot v1.25.0是一款用于纳米孔测序数据质量控制和可视化的工具，可生成多种统计图表，帮助分析测序数据的质量、长度分布及其他关键指标。
1万+ 次下载1 年前更新
nanozoo/template
nanozoo
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nanozoo/pangolin
nanozoo
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nanozoo/seqrs
nanozoo
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nanozoo/nextclade
nanozoo
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nanozoo/minimap2
nanozoo
minimap2 v2.17 Docker镜像，提供高效的DNA/RNA序列比对功能，支持长读长和短读长数据，适用于基因组学和生物信息学领域的序列比对分析。
1万+ 次下载2 年前更新
ai/granite-4.0-nano
Docker AI 官方镜像
Granite-4.0-Nano是一款轻量级指令模型，通过监督微调、强化学习和模型合并技术在多样化数据集上训练而成，具备强指令遵循能力，适用于设备端部署和研究场景，紧凑尺寸便于专业领域微调。
9.4千+ 次下载7 个月前更新
nanozoo/abricate
nanozoo
用于从基因组数据中快速查找抗生素耐药基因、毒力因子及质粒复制子等特定基因的工具，支持多种数据库，适用于微生物基因组分析。
1万+ 次下载1 年前更新
nanozoo/pangolin-v4
nanozoo
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nanozoo/artic
nanozoo
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nanozoo/sourmash
nanozoo
基于sourmash vv2.0.1的Docker镜像，用于快速比较基因组序列，维护者Christian，许可证BSD-3-Clause public-domain，详细文档见Dockerwiki。
1万+ 次下载1 年前更新
nanozoo/flye
nanozoo
Flye是一个用于长读长测序数据的基因组组装工具，特别适用于PacBio和Oxford Nanopore技术生成的数据，能够高效组装复杂基因组。
1万+ 次下载1 年前更新
nanozoo/krona
nanozoo
基于marbl/Krona项目的Docker镜像，提供Krona工具的运行环境，用于交互式可视化分类数据，支持生成动态HTML报告，广泛应用于生物信息学等领域。
1万+ 次下载5 年前更新
nanozoo/fastp
nanozoo
fastp是一款快速的一体化FastQ文件预处理工具，用于对FastQ格式测序数据进行高效预处理。
1 次收藏1万+ 次下载4 年前更新
nanozoo/kraken2
nanozoo
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1万+ 次下载5 年前更新
nanozoo/seqtk
nanozoo
seqtk v1.3 Docker镜像是用于快速处理FASTA/FASTQ序列数据的工具，支持序列提取、过滤、转换等操作，适用于生物信息学领域的序列数据预处理。
1万+ 次下载6 年前更新
ai/granite-4.0-h-nano
Docker AI 官方镜像
Granite-4.0-H Nano是通过监督微调、强化学习和模型合并在多样化数据上训练的轻量级指令模型，具备强大的指令遵循能力，适用于设备端部署、研究及专业领域微调，无需大量计算资源。
1 次收藏4.5千+ 次下载7 个月前更新
biocontainers/pbbanana
biocontainers
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nanozoo/altair
nanozoo
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1万+ 次下载6 年前更新
nanozoo/covarplot
nanozoo
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8.4千+ 次下载10 个月前更新
nanozoo/nextclade2
nanozoo
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8.5千+ 次下载2 年前更新
nanozoo/bcftools
nanozoo
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8.5千+ 次下载2 年前更新
nanozoo/seqkit
nanozoo
seqkit v0.10.1 Docker镜像是基于shenwei356/seqkit的生物信息学工具镜像，提供FASTA/FASTQ序列数据的高效处理功能，包括搜索、过滤、转换和统计分析，简化序列数据分析流程。
1 次收藏7.7千+ 次下载2 年前更新
nanozoo/mitos
nanozoo
mitos v2.0.3镜像，源自GitLab仓库https://gitlab.com/Bernt/MITOS/，维护者为Martin，采用MIT许可证，具体功能详情可参考官方文档。
7.8千+ 次下载2 年前更新
nanozoo/ggplot2
nanozoo
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nanozoo/bakta
nanozoo
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nanozoo/template
nanozoo
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nanozoo/pangolin
nanozoo
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nanozoo/fastq_utils
nanozoo
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nanozoo/raxml
nanozoo
RAxML v8.2.12系统发育分析工具Docker镜像，用于基于最大似然法构建系统发育树，支持DNA、蛋白质序列分析，遵循GPL许可证。
1.6千+ 次下载6 年前更新
nanozoo/r_ggplot2
nanozoo
包含ggplot2、dplyr等多种R数据分析和可视化工具的Docker镜像，适用于数据处理、统计分析及图表生成。
1.5千+ 次下载4 年前更新
nanozoo/hmmer
nanozoo
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nanozoo/bioruby
nanozoo
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nanozoo/checkv
nanozoo
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nanozoo/pilon
nanozoo
pilon v1.23 Docker镜像，封装了Broad Institute开发的基因组分析工具，用于基因组组装改进、错误修正和变异检测，遵循GPLv2许可证。
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nanozoo/lofreq
nanozoo
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nanozoo/mmseqs2
nanozoo
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nanozoo/dammit
nanozoo
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nanozoo/metabat2
nanozoo
metabat2 v2.13的Docker镜像，是由伯克利实验室开发的宏基因组分箱工具，用于将组装的宏基因组序列分箱到不同的基因组箱中，遵循BSD-3-Clause-LBNL许可证。
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nanozoo/fasttree
nanozoo
FastTree v2.1.10的Docker镜像，用于快速构建大型系统发育树，支持DNA、RNA和蛋白质序列分析，适用于基因组学和进化生物学研究。
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nanozoo/metawrap
nanozoo
该Docker镜像源自metaWRAP项目，仅包含BIN-REFINMENT模块，用于宏基因组数据分析中的分箱优化，分箱工具需通过单独容器提供。
1千+ 次下载5 年前更新
nanozoo/deseq2
nanozoo
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biocontainers/deepnano
biocontainers
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nanozoo/paml
nanozoo
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nanozoo/pycoqc
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pycoQC是一个基于Python的Oxford Nanopore测序数据质量控制工具，用于处理和可视化测序数据质量指标，支持多种输入格式，帮助研究人员快速评估测序数据质量。
1千+ 次下载5 年前更新
nanozoo/maxbin2
nanozoo
MaxBin2 v2.2.7的Docker镜像，用于宏基因组数据分箱，可将宏基因组序列分配到不同基因组箱，支持微生物群落基因组研究中的自动分箱分析。
982 次下载6 年前更新
nanozoo/mafft
nanozoo
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912 次下载3 年前更新
nanozoo/kaiju
nanozoo
Kaiju v1.7.2的Docker镜像，是用于宏基因组数据中快速分类读段的生物信息学工具，支持基于蛋白质或核苷酸数据库的高效比对与物种分类。
902 次下载6 年前更新
nanozoo/emboss
nanozoo
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894 次下载5 年前更新
biocontainers/deepnano-data
biocontainers
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nanozoo/bedtools
nanozoo
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847 次下载2 年前更新
nanozoo/mosdepth
nanozoo
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811 次下载4 年前更新
nanozoo/ucsc-utils
nanozoo
UCSC基因组学工具集(ucsc-utils)v377镜像，包含UCSC提供的各类基因组数据处理工具，适用于生物信息学研究中的基因组数据分析与处理任务。
796 次下载6 年前更新
nanozoo/rsem
nanozoo
RSEM v1.11 Docker镜像，用于RNA测序（RNA-Seq）数据的定量分析，可估计基因和转录本的表达水平，支持转录组参考索引构建及表达矩阵生成。
790 次下载6 年前更新
nanozoo/concoct
nanozoo
CONCOCT v1.1.0是一款用于宏基因组数据分箱的工具，可从混合微生物群落测序数据中分离不同微生物的基因组，由Christian维护，基于BSD许可证发布。
784 次下载6 年前更新
nanozoo/biopython
nanozoo
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743 次下载3 个月前更新
nanozoo/trinity
nanozoo
Trinity RNA-Seq v2.8.5 Docker镜像是基于Trinity软件构建的转录组组装工具，用于从RNA-Seq数据中从头组装高质量转录本，支持生物信息学研究中的转录组分析。
751 次下载5 年前更新
nanozoo/shasta
nanozoo
https://github.com/chanzuckerberg/shasta
750 次下载4 年前更新
biocontainers/nanosv
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1.3千+ 次下载5 年前更新
nanozoo/mash
nanozoo
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731 次下载6 年前更新
nanozoo/detonate
nanozoo
detonate是Dewey实验室开发的序列比对工具Docker镜像，版本v1.11，用于生物信息学领域的基因组序列比较与分析，支持高效序列比对任务。
721 次下载6 年前更新
nanozoo/snippy
nanozoo
FROM: https://github.com/tseemann/snippy
718 次下载2 年前更新
nanozoo/braker2
nanozoo
braker2 v2.1.4 Docker镜像是基于GitHub Gaius-Augustus/BRAKER项目构建的基因预测工具，用于真核生物基因结构预测，遵循Artistic License。
715 次下载6 年前更新
nanozoo/megahit
nanozoo
超快速宏基因组组装器Docker镜像，版本v1.2.4-beta，用于高效组装宏基因组数据。
680 次下载6 年前更新
nanozoo/newick_utils
nanozoo
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637 次下载6 年前更新
nanozoo/gtdbtk
nanozoo
GTDBTk v0.3.2 Docker镜像，基于Ecogenomics/GtdbTk项目，用于微生物基因组的系统发育分类，支持细菌和古菌的分类单元分配与系统发育分析。
616 次下载2 年前更新
nanozoo/bracken
nanozoo
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608 次下载3 年前更新
nanozoo/metamaps
nanozoo
基于DiltheyLab/MetaMaps项目构建的Docker镜像，主要用于tax read classification（分类读取分类）任务，提供便捷的容器化部署环境，遵循MIT许可证。
1 次收藏622 次下载6 年前更新
nanozoo/krakentools
nanozoo
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615 次下载3 年前更新
nanozoo/canu
nanozoo
Canu是一款用于长读长测序数据的基因组组装工具，适用于PacBio和Oxford Nanopore等平台的长DNA序列组装，基于GNU GENERAL PUBLIC LICENSE许可。
589 次下载5 年前更新
nanozoo/osf
nanozoo
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nanozoo/hyphy
nanozoo
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nanozoo/pylibsgoogle
nanozoo
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559 次下载4 个月前更新
nanozoo/pomoxis
nanozoo
FROM: https://github.com/nanoporetech/pomoxis
559 次下载5 年前更新
nanozoo/marine-phage-paper-scripts
nanozoo
用于从纳米孔原始数据中进行无需组装的海洋噬菌体检测的Python脚本套件，基于Beaulaurier等人的研究成果。
546 次下载6 年前更新
nanozoo/raxml-ng
nanozoo
raxml-ng v0.9.0是一个高效的系统发育分析工具，用于基于最大似然法推断进化树，支持DNA、蛋白质和二进制数据，适用于进化生物学和生物信息学研究。
531 次下载4 年前更新
nanozoo/python3.12
nanozoo
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nanozoo/cutadapt
nanozoo
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nanozoo/cdhit
nanozoo
cd-hit v4.8.1 Docker镜像是基于https://github.com/weizhongli/cdhit构建的序列聚类工具，用于蛋白质或核酸序列的快速聚类和冗余去除，适用于生物信息学数据分析。
493 次下载3 年前更新
nanozoo/gubbins
nanozoo
基于sanger-pathogens/gubbins项目的Docker镜像，用于细菌基因组重组区域识别及系统发育树构建，支持版本v2.3.4，遵循GPL-2.0许可证。
483 次下载3 年前更新
nanozoo/rnaquast
nanozoo
rnaquast v1.5.1是由Martin维护的RNA-seq组装质量评估工具Docker镜像，遵循GPLv2许可证，用于评估RNA测序组装结果的质量，源码来源于https://github.com/ablab/rnaquast。
468 次下载6 年前更新
nanozoo/dada2
nanozoo
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464 次下载4 个月前更新
nanozoo/paftools
nanozoo
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452 次下载3 年前更新
nanozoo/treetime
nanozoo
TreeTime v0.6.3是一款基于neherlab/treetime项目的系统发育树时间校准与进化分析工具，支持通过序列数据推断分化时间、进化速率及构建时间结构化树，适用于病毒进化、流行病学等研究场景。
452 次下载6 年前更新
nanozoo/hdbscan
nanozoo
基于GitHub项目lmcinnes/hdbscan构建的Docker镜像，提供v0.8.23版本的HDBSCAN聚类算法，用于高效的数据聚类分析任务。
438 次下载6 年前更新
nanozoo/gtdb-downloader
nanozoo
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436 次下载1 年前更新
nanozoo/umap
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umap-learn v0.3.10 Docker镜像，提供高维数据降维功能，适用于机器学习和数据分析中的数据可视化与特征提取，遵循3-clause BSD许可，由Martin维护，基于GitHub项目http://github.com/lmcinnes/umap构建。
443 次下载6 年前更新
nanozoo/transrate
nanozoo
FROM: https://github.com/blahah/transrate
439 次下载7 年前更新
nanozoo/repeatmasker
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435 次下载6 年前更新
nanozoo/lumpy
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Boxes是一个包含成功构建的Dockerfile集合，主要用于结构变异检测相关应用的部署，提供可靠的环境配置。
412 次下载7 年前更新
nanozoo/pfam_scan
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pfam_scan v1.6 Docker镜像，提供pfam_scan.pl工具，用于扫描蛋白质序列中的Pfam结构域，支持生物信息学研究中的蛋白质功能注释与结构分析。
412 次下载6 年前更新
nanozoo/finance
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1 次收藏410 次下载1 年前更新
nanozoo/fastani
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FastANI 1.3 Docker镜像，用于快速计算全基因组平均核苷酸一致性（ANI），支持高效的基因组相似性分析与比较，适用于微生物基因组研究场景。
404 次下载6 年前更新
nanozoo/dorado
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nanozoo/metaeuk
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nanozoo/wtdbg2_polish
nanozoo
Boxes是一个成功构建的Dockerfile集合，主要包含用于基因组组装的工具（如wtdbg2），便于快速部署和使用相关生物信息学分析环境。
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