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balenalib/floyd-nano-python

该镜像属于balena.io的IoT设备基础镜像系列，优化用于balena.io和balenaOS，也可在任何适当架构的Docker环境中使用，提供便捷的包管理和动态设备支持功能。

1万+ 次下载2 年前更新

library/python

Docker 官方镜像

Python是一种解释型、交互式、面向对象的开源编程语言，其设计理念强调代码的可读性与简洁性，支持多种编程范式，凭借丰富的标准库和第三方库，广泛应用于Web开发、数据分析、人工智能、科学计算、自动化脚本等众多领域，拥有活跃的全球开发者社区，是兼具易用性与强大功能的高效编程工具。

1万次收藏10亿+ 次下载6 天前更新

nanozoo/nanoplot

NanoPlot v1.25.0是一款用于纳米孔测序数据质量控制和可视化的工具，可生成多种统计图表，帮助分析测序数据的质量、长度分布及其他关键指标。

1万+ 次下载1 年前更新

cimg/python

CircleCI提供的`cimg/python`是专为持续集成构建设计的Docker镜像，包含完整Python版本（通过pyenv），预装pip、pipenv和poetry，适用于CircleCI环境，旨在取代旧版`circleci/python`镜像。

25 次收藏1亿+ 次下载3 天前更新

circleci/python

CircleCI提供的Python扩展镜像，基于官方Python镜像，预装开发和CI常用工具（如git、ssh、docker等），默认使用非root用户，支持浏览器测试等变体，适用于CI/CD流程和开发环境。

116 次收藏1亿+ 次下载4 年前更新

nanozoo/python_rnaseq

2.9千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/template

1万+ 次下载3 个月前更新

nanozoo/pangolin

1万+ 次下载4 年前更新

nanozoo/seqrs

1万+ 次下载5 年前更新

nanozoo/nextclade

1万+ 次下载3 年前更新

nanozoo/minimap2

minimap2 v2.17 Docker镜像，提供高效的DNA/RNA序列比对功能，支持长读长和短读长数据，适用于基因组学和生物信息学领域的序列比对分析。

1万+ 次下载2 年前更新

ai/granite-4.0-nano

Docker AI 官方镜像

Granite-4.0-Nano是一款轻量级指令模型，通过监督微调、强化学习和模型合并技术在多样化数据集上训练而成，具备强指令遵循能力，适用于设备端部署和研究场景，紧凑尺寸便于专业领域微调。

9.4千+ 次下载7 个月前更新

demisto/python3

6 次收藏1000万+ 次下载15 天前更新

demisto/python

基于python:2.7的Demisto基础Python镜像，包含requests、olefile、pip和stix等基本Python库，适用于构建依赖这些特定库的Python 2.7应用环境。

5 次收藏100万+ 次下载5 个月前更新

nanozoo/abricate

用于从基因组数据中快速查找抗生素耐药基因、毒力因子及质粒复制子等特定基因的工具，支持多种数据库，适用于微生物基因组分析。

1万+ 次下载1 年前更新

nanozoo/pangolin-v4

1万+ 次下载8 天前更新

nanozoo/artic

1万+ 次下载3 年前更新

nanozoo/flye

Flye是一个用于长读长测序数据的基因组组装工具，特别适用于PacBio和Oxford Nanopore技术生成的数据，能够高效组装复杂基因组。

1万+ 次下载1 年前更新

nanozoo/sourmash

基于sourmash vv2.0.1的Docker镜像，用于快速比较基因组序列，维护者Christian，许可证BSD-3-Clause public-domain，详细文档见Dockerwiki。

1万+ 次下载1 年前更新

nanozoo/krona

基于marbl/Krona项目的Docker镜像，提供Krona工具的运行环境，用于交互式可视化分类数据，支持生成动态HTML报告，广泛应用于生物信息学等领域。

1万+ 次下载5 年前更新

nanozoo/fastp

fastp是一款快速的一体化FastQ文件预处理工具，用于对FastQ格式测序数据进行高效预处理。

1 次收藏1万+ 次下载4 年前更新

nanozoo/kraken2

1万+ 次下载5 年前更新

nanozoo/seqtk

seqtk v1.3 Docker镜像是用于快速处理FASTA/FASTQ序列数据的工具，支持序列提取、过滤、转换等操作，适用于生物信息学领域的序列数据预处理。

1万+ 次下载6 年前更新

ai/granite-4.0-h-nano

Docker AI 官方镜像

Granite-4.0-H Nano是通过监督微调、强化学习和模型合并在多样化数据上训练的轻量级指令模型，具备强大的指令遵循能力，适用于设备端部署、研究及专业领域微调，无需大量计算资源。

1 次收藏4.5千+ 次下载7 个月前更新

nanozoo/altair

1万+ 次下载6 年前更新

nanozoo/python3.12

530 次下载2 年前更新

nanozoo/biopython

743 次下载3 个月前更新

nanozoo/covarplot

8.4千+ 次下载10 个月前更新

nanozoo/nextclade2

8.5千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/bcftools

8.5千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/seqkit

seqkit v0.10.1 Docker镜像是基于shenwei356/seqkit的生物信息学工具镜像，提供FASTA/FASTQ序列数据的高效处理功能，包括搜索、过滤、转换和统计分析，简化序列数据分析流程。

1 次收藏7.7千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/mitos

mitos v2.0.3镜像，源自GitLab仓库https://gitlab.com/Bernt/MITOS/，维护者为Martin，采用MIT许可证，具体功能详情可参考官方文档。

7.8千+ 次下载2 年前更新

amazon/aws-lambda-python

AWS提供的Lambda基础镜像，包含Amazon Linux系统、运行时、依赖及Lambda Runtime Interface Client，用于将函数打包为容器镜像并在AWS Lambda上运行。

105 次收藏100万+ 次下载26 天前更新

nanozoo/python_ribap

394 次下载3 年前更新

nanozoo/ggplot2

6.1千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/bakta

5.7千+ 次下载8 个月前更新

nanozoo/hisat2

一个快速且灵敏的下一代测序读段比对程序Docker镜像，用于映射NGS数据，包含samtools=1.9以支持后续数据处理。

1 次收藏5.5千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/fastqc

基于FastQC的Docker镜像，用于生成（短读）下一代测序（NGS）数据的质量报告，支持NGS数据的质量控制与评估。

5.3千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/medaka

基于nanoporetech/medaka项目的Docker镜像，用于纳米孔测序数据（fastq格式）的polishing处理，提升测序结果准确性。

2 次收藏5.6千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/subread

subread v1.6.4 Docker镜像，封装了高通量测序数据分析工具，支持reads比对、基因表达定量及剪接位点检测等功能，适用于RNA-seq、ChIP-seq等测序数据处理，简化生物信息学分析部署流程。

5.2千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/jq

5.4千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/prodigal

Prodigal v2.6.3-1 Docker镜像是用于原核生物（细菌和古菌）蛋白质编码基因预测的工具，支持高效准确的基因识别，遵循GPLv3许可证。

5.3千+ 次下载6 年前更新

okteto/python

该镜像包含用于与Okteto CLI配合使用的Python开发环境，Okteto是面向开发者的Kubernetes工具。

10万+ 次下载2 个月前更新

nanozoo/samtools

5.1千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/guppy_cpu

ONT Guppy碱基识别器Docker镜像，仅支持CPU运行，用于对纳米孔测序数据进行碱基识别处理。

4.5千+ 次下载5 年前更新

demisto/python3-deb

100万+ 次下载8 天前更新

nanozoo/simple-circularise

基于Python脚本的Docker镜像，用于对本应环形但在组装过程中重叠的线性序列或序列列表进行简单环化处理。

4.6千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/prokka

Prokka v1.14.5 Docker镜像，用于原核生物基因组的快速注释，集成基因预测、功能注释工具，支持多种输出格式，适用于微生物基因组分析与研究场景。

4.5千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/fargene

fargene v0.1是基于GitHub项目https://github.com/fannyhb/fargene的工具镜像，提供基因分析相关功能，由Christian维护，遵循MIT许可证。

4.4千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/diamond

https://github.com/bbuchfink/diamond

4.3千+ 次下载11 个月前更新

nanozoo/filtlong

Filtlong是一款长读长测序数据过滤工具，可根据长度、质量和比对信息去除低质量读段，提高基因组组装等下游分析的准确性和效率，适用于PacBio、Nanopore等长读长测序数据预处理。

4.2千+ 次下载5 年前更新

biocontainers/nanook

8千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/bwa

3.9千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/texlive-core

1 次收藏3.6千+ 次下载6 年前更新

ubuntu/python

Ubuntu 官方镜像

这是一个基于Ubuntu系统精雕细琢而成的运行基石，集成了Python运行时环境，通过精简优化的系统底层确保了高效稳定的性能，为Python应用程序提供了可靠的运行载体，无论是开发调试、测试验证还是生产部署场景，都能满足轻量、安全且高效的运行需求，是构建Python应用生态的理想基础组件。

33 次收藏10万+ 次下载3 天前更新

demisto/pan-os-python

10万+ 次下载15 天前更新

nanozoo/shovill

Shovill v1.0.9 Docker镜像是基于GitHub项目tseemann/shovill的细菌基因组组装工具，集成SPAdes、Velvet等组装器，支持短读长测序数据的自动化基因组组装，适用于微生物基因组学研究。

3.8千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/nextclade3

3.5千+ 次下载8 天前更新

nanozoo/bandage

Bandage Docker镜像是基于rrwick/Bandage项目的基因组组装可视化工具，用于展示和分析基因组组装结果中的contig连接情况，支持交互式查看和操作组装图。

3.5千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/sortmerna

3.2千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/stringtie

3.4千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/racon

racon v1.4.7 Docker镜像，用于基因组组装中长读长测序数据的校正，基于lbcb-sci/racon项目构建，支持PacBio和Oxford Nanopore等长读长数据的准确性优化。

1 次收藏3.1千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/unicycler

Unicycler v0.4.8-0 Docker镜像是基于rrwick/Unicycler的基因组组装工具，用于结合短读长（如Illumina）和长读长（如PacBio/Nanopore）测序数据进行细菌基因组组装，支持生成高质量环形基因组。

3.1千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/r_ggpubr

2.8千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/guppy_gpu

Oxford Nanopore Technologies (ONT) Guppy碱基识别工具的GPU加速版本，基于CUDA容器实现，需配合nvidia-docker使用以支持GPU加速。

1 次收藏2.7千+ 次下载3 年前更新

nanozoo/bowtie2

包含bowtie2和samtools的Docker镜像，提供高效短序列比对及SAM/BAM文件处理功能，适用于生物信息学中基因组测序数据的分析流程。

2.6千+ 次下载2 年前更新

datadog/dd-lib-python-init

10万+ 次下载2 天前更新

nanozoo/centrifuge

基于Centrifuge的taxonomy分类器Docker镜像，包含filter-reads-ont.sh脚本，用于过滤Centrifuge输出结果，自动去除匹配长度小于150bp及分数低于200的假阳性分类结果。

2.6千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/nanopolish

122 次下载4 年前更新

nanozoo/bbmap

2.3千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/spades

SPAdes基因组组装工具Docker镜像，用于单胞菌、宏基因组等复杂基因组序列的高效组装，支持多种测序数据类型，基于GNU GPLv2许可证。

2.2千+ 次下载3 年前更新

nanozoo/multiqc

MultiQC是一款生物信息学工具，能够将多个样本的生物信息学分析结果聚合为单个综合报告，便于结果查看与比较。

2.3千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/eggnog-mapper

1 次收藏2.2千+ 次下载10 个月前更新

nanozoo/busco

BUSCO v3.0.2 Docker镜像，用于基于universal single-copy orthologs基准评估基因组组装和注释的完整性，适用于基因组学研究与分析。

2千+ 次下载1 年前更新

nanozoo/checkm

该Docker镜像包含预配置的CheckM工具、谱系数据库及数据集根目录设置，可直接用于宏基因组组装的质量评估，包括基因组完整性和污染率分析，开箱即用无需额外配置。

2.1千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/rmarkdown

2千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/r_fungi

1.8千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/python

154 次下载2 年前更新

nanozoo/plasflow

1.9千+ 次下载5 年前更新

demisto/python-deb

5万+ 次下载2 年前更新

paketobuildpacks/python

paketobuildpacks

100万+ 次下载3 天前更新

nanozoo/upsetr

UpSetR v1.4.0 Docker镜像，基于R包实现集合交集可视化功能，适用于生物信息学及多数据集交集分析场景，帮助直观展示数据重叠关系。

1.8千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/quast

quast v5.0.2 Docker镜像是基因组组装质量评估工具，用于评估基因组组装结果质量，计算N50、L50、基因组大小等关键指标，生成详细报告，帮助研究人员快速评估组装完整性和准确性。

1 次收藏1.7千+ 次下载3 年前更新

nanozoo/fastq_utils

1.6千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/raxml

RAxML v8.2.12系统发育分析工具Docker镜像，用于基于最大似然法构建系统发育树，支持DNA、蛋白质序列分析，遵循GPL许可证。

1.6千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/hmmer

1 次收藏1.4千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/r_ggplot2

包含ggplot2、dplyr等多种R数据分析和可视化工具的Docker镜像，适用于数据处理、统计分析及图表生成。

1.5千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/bioruby

1.4千+ 次下载6 年前更新

jetbrains/qodana-python

Qodana Python镜像为Python项目提供静态代码分析功能，可检测代码质量问题、安全漏洞及代码风格违规，帮助开发者提升代码可靠性与开发效率。

1 次收藏10万+ 次下载1 个月前更新

nanozoo/checkv

1.4千+ 次下载4 年前更新

nanozoo/pilon

pilon v1.23 Docker镜像，封装了Broad Institute开发的基因组分析工具，用于基因组组装改进、错误修正和变异检测，遵循GPLv2许可证。

1.3千+ 次下载4 年前更新

demisto/python-phash

10万+ 次下载14 天前更新

nanozoo/lofreq

1.2千+ 次下载5 年前更新

nanozoo/mmseqs2

1.1千+ 次下载3 年前更新

demisto/python-phash

10万+ 次下载14 天前更新

nanozoo/metabat2

metabat2 v2.13的Docker镜像，是由伯克利实验室开发的宏基因组分箱工具，用于将组装的宏基因组序列分箱到不同的基因组箱中，遵循BSD-3-Clause-LBNL许可证。

1.1千+ 次下载2 年前更新

nanozoo/fasttree

FastTree v2.1.10的Docker镜像，用于快速构建大型系统发育树，支持DNA、RNA和蛋白质序列分析，适用于基因组学和进化生物学研究。

1.1千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/metawrap

该Docker镜像源自metaWRAP项目，仅包含BIN-REFINMENT模块，用于宏基因组数据分析中的分箱优化，分箱工具需通过单独容器提供。

1千+ 次下载5 年前更新

biocontainers/deepnano

8.4千+ 次下载6 年前更新

nanozoo/deseq2

1千+ 次下载3 年前更新

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